22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3319 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  100 
 
 		 2159 aa  4188    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2514  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1338 aa  307  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.482262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  29.2 
 
 		 7919 aa  292  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  27.61 
 
 		 7679 aa  280  3e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  30.29 
 
 		 6211 aa  175  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  29.08 
 
 		 5123 aa  167  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  29.09 
 
 		 2825 aa  112  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  27.15 
 
 		 6006 aa  106  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  27.75 
 
 		 3263 aa  103  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1278  hypothetical protein  47.18 
 
 		 572 aa  100  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1277  hypothetical protein  29.66 
 
 		 479 aa  90.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 5009 aa  89.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  25.96 
 
 		 5769 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  27.49 
 
 		 7233 aa  81.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  26.29 
 
 		 4748 aa  68.6  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 		 2452 aa  62.8  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 5171 aa  62.4  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  31.55 
 
 		 2336 aa  57.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  26.92 
 
 		 3184 aa  52.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4208  autotransporter adhesin  23.85 
 
 		 3333 aa  51.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.59 
 
 		 3038 aa  47.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  28.04 
 
 		 1232 aa  45.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>