More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1665 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  51.06 
 
 		 6006 aa  1617    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  42.4 
 
 		 7919 aa  853    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  100 
 
 		 2825 aa  5466    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  39.46 
 
 		 5009 aa  1083    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  46.64 
 
 		 7233 aa  1350    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1846  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 4876 aa  545  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  48.17 
 
 		 4748 aa  422  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  35.57 
 
 		 1232 aa  383  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  32.36 
 
 		 6211 aa  345  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  31.23 
 
 		 5123 aa  324  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  28.8 
 
 		 3184 aa  261  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  43.97 
 
 		 2887 aa  252  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.46 
 
 		 5769 aa  240  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  36.67 
 
 		 1598 aa  228  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  37.16 
 
 		 1867 aa  196  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  34.2 
 
 		 2127 aa  162  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  27.48 
 
 		 7679 aa  153  5e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  29.73 
 
 		 3263 aa  149  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  34.18 
 
 		 2478 aa  132  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.71 
 
 		 3038 aa  101  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.3 
 
 		 2667 aa  99.8  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  26.85 
 
 		 2743 aa  98.2  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 824 aa  97.4  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 2107 aa  89  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.07 
 
 		 1499 aa  87.8  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  44.09 
 
 		 1538 aa  88.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  32.99 
 
 		 2329 aa  86.7  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  32.99 
 
 		 942 aa  86.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 		 5098 aa  85.5  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  36.9 
 
 		 3314 aa  85.5  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  30.56 
 
 		 2105 aa  85.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  36.8 
 
 		 932 aa  85.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.14 
 
 		 11716 aa  84.7  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  30.43 
 
 		 1019 aa  82.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.19 
 
 		 3619 aa  82.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.26 
 
 		 3209 aa  80.5  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 946 aa  80.9  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3319  structural toxin protein RtxA  28.12 
 
 		 2159 aa  80.5  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.2 
 
 		 1236 aa  80.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 		 1534 aa  79.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.08 
 
 		 588 aa  79  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.29 
 
 		 4334 aa  79  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.33 
 
 		 3598 aa  79  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.78 
 
 		 1855 aa  78.2  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.6 
 
 		 4687 aa  77.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.88 
 
 		 1403 aa  77.4  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  32.77 
 
 		 1164 aa  77.4  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  36.46 
 
 		 2954 aa  77  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.33 
 
 		 4798 aa  77  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.68 
 
 		 1480 aa  77  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  32.21 
 
 		 3608 aa  76.6  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.52 
 
 		 1156 aa  76.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.92 
 
 		 999 aa  76.6  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  35.38 
 
 		 2775 aa  76.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  41.86 
 
 		 1141 aa  76.6  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.36 
 
 		 3427 aa  76.3  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.5 
 
 		 2911 aa  75.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  46.43 
 
 		 3091 aa  75.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  30.84 
 
 		 820 aa  75.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.77 
 
 		 3396 aa  74.7  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  30.57 
 
 		 928 aa  74.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 		 5171 aa  74.3  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.97 
 
 		 1279 aa  73.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.54 
 
 		 795 aa  73.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  36.8 
 
 		 1079 aa  73.2  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  31.2 
 
 		 727 aa  73.2  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  34.19 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.62 
 
 		 1532 aa  72.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  31.8 
 
 		 3619 aa  72  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.58 
 
 		 855 aa  72.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  34.89 
 
 		 1895 aa  72.4  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  31.14 
 
 		 1883 aa  72  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  31.21 
 
 		 1055 aa  71.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.08 
 
 		 2678 aa  71.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  26.97 
 
 		 648 aa  71.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.6 
 
 		 980 aa  71.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3412  hypothetical protein  36.02 
 
 		 2625 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  43.02 
 
 		 2836 aa  71.2  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 		 982 aa  71.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  42.06 
 
 		 1166 aa  70.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.56 
 
 		 1795 aa  70.1  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.09 
 
 		 2807 aa  70.1  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  30.74 
 
 		 959 aa  69.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  32.79 
 
 		 329 aa  70.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  32.97 
 
 		 928 aa  69.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4380  hypothetical protein  31.25 
 
 		 3923 aa  68.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.05 
 
 		 1712 aa  68.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2686  lipase, class 3  31.36 
 
 		 617 aa  68.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.458877  unclonable  0.0000292693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 1789 aa  68.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.45 
 
 		 1544 aa  67.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 		 491 aa  67.8  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.61 
 
 		 1839 aa  67.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  29.59 
 
 		 3026 aa  67  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  31.42 
 
 		 518 aa  67.4  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  52.5 
 
 		 582 aa  67.4  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  52.5 
 
 		 585 aa  67.4  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  32.84 
 
 		 1814 aa  67  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  31.2 
 
 		 503 aa  67  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  29.35 
 
 		 851 aa  66.6  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>