75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02371 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  61.4 
 
 		 2042 aa  1039    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  100 
 
 		 2127 aa  4139    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  36.48 
 
 		 4285 aa  380  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.47 
 
 		 2812 aa  350  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  45.32 
 
 		 6779 aa  335  5e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.32 
 
 		 6683 aa  335  8e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  45.32 
 
 		 6662 aa  335  8e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.93 
 
 		 2239 aa  328  5e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  34.29 
 
 		 2542 aa  304  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  37.08 
 
 		 2251 aa  244  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.71 
 
 		 5098 aa  202  6e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  33.4 
 
 		 1598 aa  201  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.75 
 
 		 3396 aa  175  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  28.7 
 
 		 2887 aa  154  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1665  outer membrane adhesin like proteiin  34.2 
 
 		 2825 aa  154  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  31.97 
 
 		 5171 aa  152  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 1232 aa  145  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  29.89 
 
 		 1867 aa  144  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.57 
 
 		 1340 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.28 
 
 		 2194 aa  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  26.96 
 
 		 3259 aa  129  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0782  von Willebrand factor type A  29.34 
 
 		 5009 aa  124  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 		 2478 aa  120  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.15 
 
 		 1661 aa  112  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.08 
 
 		 1222 aa  112  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  44.06 
 
 		 4848 aa  110  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1662  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 6006 aa  108  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  36.97 
 
 		 7149 aa  107  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.62 
 
 		 1225 aa  105  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1806  hemolysin-type calcium-binding region  25.85 
 
 		 3184 aa  103  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1979  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.04 
 
 		 3038 aa  102  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.109352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.83 
 
 		 1118 aa  102  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  26.95 
 
 		 1029 aa  102  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.08 
 
 		 1029 aa  102  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.72 
 
 		 1113 aa  95.9  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  40.58 
 
 		 814 aa  94.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  30.5 
 
 		 8871 aa  92.8  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.03 
 
 		 1269 aa  89  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.03 
 
 		 1269 aa  89  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  22.25 
 
 		 2743 aa  83.6  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.02 
 
 		 1800 aa  83.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0020  hemolysin-type calcium-binding protein  24.07 
 
 		 2890 aa  80.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4138  hypothetical protein  34.27 
 
 		 3182 aa  79  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.91 
 
 		 1009 aa  78.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.8 
 
 		 889 aa  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  27.08 
 
 		 2310 aa  75.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.42 
 
 		 1012 aa  72.8  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4137  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.79 
 
 		 1599 aa  71.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0632  outer membrane adhesin like proteiin  27.53 
 
 		 7233 aa  68.9  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  31.87 
 
 		 2305 aa  68.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  30.06 
 
 		 1037 aa  67  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  26.28 
 
 		 16311 aa  65.9  0.000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.02 
 
 		 768 aa  65.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.45 
 
 		 891 aa  64.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  29.12 
 
 		 2537 aa  62.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  25.29 
 
 		 4854 aa  61.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  24.46 
 
 		 9030 aa  60.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  28.03 
 
 		 2452 aa  60.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  23.23 
 
 		 8682 aa  59.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  24.66 
 
 		 6753 aa  59.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  25.32 
 
 		 4013 aa  58.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06128  hypothetical protein  27.61 
 
 		 6211 aa  58.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  27.35 
 
 		 4214 aa  54.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  34.51 
 
 		 2336 aa  55.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000324  autotransporter adhesin  31.89 
 
 		 5123 aa  53.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  32.81 
 
 		 582 aa  53.1  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.26 
 
 		 928 aa  52.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  40.38 
 
 		 5769 aa  52.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 		 625 aa  52  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.56 
 
 		 3314 aa  50.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  27.88 
 
 		 317 aa  49.3  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0388  hypothetical protein  33.6 
 
 		 3263 aa  48.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  27.19 
 
 		 5218 aa  47  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.57 
 
 		 4836 aa  46.6  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 647 aa  46.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>