90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49215 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49216  predicted protein  60.37 
 
 
694 aa  673    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.127578  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  100 
 
 
582 aa  1206    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  30.51 
 
 
490 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 
562 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  30.66 
 
 
774 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  40 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  35.48 
 
 
412 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  27.94 
 
 
383 aa  57  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 
607 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 
609 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.33 
 
 
462 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.54 
 
 
712 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.11 
 
 
588 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  28.8 
 
 
605 aa  53.5  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.78 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  32.81 
 
 
2127 aa  53.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.78 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
654 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.88 
 
 
795 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.86 
 
 
523 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 
624 aa  52  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.46 
 
 
418 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 
555 aa  51.6  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  36.14 
 
 
639 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
551 aa  51.2  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 
459 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  23.47 
 
 
625 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  25.41 
 
 
750 aa  50.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 
421 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  26.96 
 
 
598 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.89 
 
 
561 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
592 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  24.7 
 
 
625 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
412 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 
570 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 
571 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 
792 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.75 
 
 
621 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
562 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  24.27 
 
 
563 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  27.48 
 
 
698 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  26.92 
 
 
651 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 
640 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 
935 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.69 
 
 
651 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  25.98 
 
 
593 aa  48.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 
589 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  26.63 
 
 
613 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  28.87 
 
 
629 aa  47.8  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 
627 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
686 aa  47.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  45.1 
 
 
536 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 
903 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  27.5 
 
 
633 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.74 
 
 
770 aa  47  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1317  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 
1017 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000794512  hitchhiker  0.000000764537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 
546 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  27.48 
 
 
706 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.58 
 
 
794 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.25 
 
 
791 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 
642 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
583 aa  46.2  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.33 
 
 
1033 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
380 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  34.15 
 
 
708 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
892 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 
642 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.79 
 
 
701 aa  45.1  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 
418 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 
717 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  31.79 
 
 
477 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  28.41 
 
 
795 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0183  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
432 aa  45.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.67 
 
 
755 aa  45.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 
559 aa  45.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.72 
 
 
479 aa  45.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.84 
 
 
722 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 
859 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  42.86 
 
 
709 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13850  Mg-chelatase subunit ChlD  27.74 
 
 
257 aa  44.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  27.88 
 
 
739 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  23.74 
 
 
642 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  32.95 
 
 
610 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
514 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.05 
 
 
772 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.65 
 
 
755 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  30.77 
 
 
942 aa  43.9  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 
1188 aa  43.9  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.65 
 
 
751 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>