More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0158 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 625 aa  1281    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  56.1 
 
 		 613 aa  641    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  53.8 
 
 		 639 aa  607  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  60.97 
 
 		 536 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  57.73 
 
 		 709 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.32 
 
 		 563 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  52 
 
 		 551 aa  488  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  49.8 
 
 		 792 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  52.54 
 
 		 640 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  47.47 
 
 		 642 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  47.46 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  47.46 
 
 		 642 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  47.28 
 
 		 642 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  49.69 
 
 		 621 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  47.69 
 
 		 625 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  47.4 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  46.11 
 
 		 566 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  47.48 
 
 		 624 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  50.96 
 
 		 706 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  48.47 
 
 		 651 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  49.05 
 
 		 651 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  49.4 
 
 		 698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  51.03 
 
 		 708 aa  449  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  49.25 
 
 		 633 aa  449  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  48.79 
 
 		 592 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  46.63 
 
 		 612 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  47.54 
 
 		 686 aa  437  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  43.93 
 
 		 571 aa  424  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  45.28 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  44.44 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  41.46 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  44.51 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.44 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  47.27 
 
 		 555 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  44.31 
 
 		 593 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  48.32 
 
 		 654 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  44.47 
 
 		 629 aa  386  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  44.24 
 
 		 555 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  50.85 
 
 		 350 aa  329  9e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  37.53 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  36.13 
 
 		 490 aa  231  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  36.23 
 
 		 500 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 859 aa  181  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  41.14 
 
 		 935 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 		 462 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.84 
 
 		 451 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 416 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.17 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 615 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.17 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.7 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.38 
 
 		 425 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.61 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.93 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.73 
 
 		 479 aa  80.1  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 		 808 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.41 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  38.89 
 
 		 92 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  23.35 
 
 		 602 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  32.29 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 		 421 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  25.91 
 
 		 701 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 		 914 aa  63.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  26.04 
 
 		 669 aa  62  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  24.48 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 1034 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  41.98 
 
 		 996 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  44.59 
 
 		 1104 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1114 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  32.67 
 
 		 1035 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  23.96 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  23.87 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1040 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  45.95 
 
 		 994 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 971 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  28.57 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  22.88 
 
 		 415 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  36.96 
 
 		 1048 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 		 966 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  41.1 
 
 		 1105 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1081 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  39.19 
 
 		 1163 aa  55.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>