66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4044 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 647 aa  1261    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  48.03 
 
 		 521 aa  242  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  37.37 
 
 		 1066 aa  157  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  45.45 
 
 		 2310 aa  92  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  37.13 
 
 		 2305 aa  90.5  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.4 
 
 		 1037 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.64 
 
 		 1012 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.51 
 
 		 1340 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.76 
 
 		 1222 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.6 
 
 		 1800 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.89 
 
 		 1225 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.4 
 
 		 2194 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.54 
 
 		 1118 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.18 
 
 		 928 aa  80.5  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.18 
 
 		 1113 aa  80.1  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40 
 
 		 1269 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 891 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.26 
 
 		 889 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.96 
 
 		 768 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.19 
 
 		 1009 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.18 
 
 		 1269 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.12 
 
 		 1180 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.74 
 
 		 1661 aa  72  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.71 
 
 		 2796 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  27.12 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  35.29 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  24.2 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.07 
 
 		 2281 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.38 
 
 		 3396 aa  62.4  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  32.94 
 
 		 8871 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  29.5 
 
 		 1831 aa  60.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  34.33 
 
 		 7149 aa  60.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  36.04 
 
 		 5444 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39 
 
 		 3168 aa  59.3  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  40 
 
 		 1053 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  32.84 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  33.76 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  33.96 
 
 		 16311 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.76 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1500  hypothetical protein  31.94 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0381829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  34.88 
 
 		 372 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  25.14 
 
 		 1300 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  35.35 
 
 		 1029 aa  53.9  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.43 
 
 		 1029 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  32.03 
 
 		 372 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  37.96 
 
 		 3394 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  30.56 
 
 		 894 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  35.71 
 
 		 438 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.31 
 
 		 1415 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  34.02 
 
 		 1222 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  31.41 
 
 		 547 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  26.75 
 
 		 458 aa  48.5  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  21.34 
 
 		 380 aa  48.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  32.71 
 
 		 894 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  31.82 
 
 		 5899 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  30.25 
 
 		 2251 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  27.05 
 
 		 1322 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  28.57 
 
 		 2127 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  31.45 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.71 
 
 		 469 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 911 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.96 
 
 		 1092 aa  45.8  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3960  secreted protein  35.65 
 
 		 815 aa  45.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.23 
 
 		 1091 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.91 
 
 		 1535 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.73 
 
 		 615 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>