35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00240 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006683  CNN00240  expressed protein  100 
 
 		 430 aa  885    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  36.22 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  36.57 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  32.5 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  34.27 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  37.1 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  34.92 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  38.71 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  34.15 
 
 		 1066 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  30.33 
 
 		 521 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  32.17 
 
 		 645 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  27.78 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  28.28 
 
 		 542 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  32.31 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09320  conserved hypothetical protein  32.06 
 
 		 1054 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  25.2 
 
 		 349 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  26.92 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  30.95 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3949  hypothetical protein  29.76 
 
 		 318 aa  54.3  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  27.94 
 
 		 230 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1107  hypothetical protein  24.36 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  28.68 
 
 		 1831 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1382  hypothetical protein  28.67 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0961  hypothetical protein  25.18 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  32.32 
 
 		 1300 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.45 
 
 		 647 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 702 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  28.99 
 
 		 663 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1233  hypothetical protein  23.02 
 
 		 414 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0143332  normal  0.037479 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  27.38 
 
 		 632 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1559  hypothetical protein  23.75 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158764  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  27.91 
 
 		 665 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 550 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>