25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1670 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  100 
 
 
702 aa  1421    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52050  ppkA-related protein  31.44 
 
 
656 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  31.12 
 
 
665 aa  253  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  31.29 
 
 
653 aa  247  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2874  ppkA-related protein  29.43 
 
 
653 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0665183  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4236  von Willebrand factor, type A  29.85 
 
 
651 aa  238  3e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.644313  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2629  von Willebrand factor, type A  29.84 
 
 
663 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102105  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  30.65 
 
 
1032 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  29.89 
 
 
632 aa  232  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  30.27 
 
 
1032 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 
659 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  28.77 
 
 
1018 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4055  hypothetical protein  27.91 
 
 
634 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0161077  normal  0.249127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0900  hypothetical protein  28.27 
 
 
640 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.207754  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  26.79 
 
 
631 aa  179  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  26.79 
 
 
631 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  26.09 
 
 
671 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.7 
 
 
629 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  25.75 
 
 
349 aa  50.1  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
233 aa  49.7  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  28.12 
 
 
430 aa  45.8  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  28.08 
 
 
380 aa  45.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  25.84 
 
 
230 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  33.59 
 
 
372 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  26.45 
 
 
1300 aa  44.3  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>