20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0941 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 458 aa  952    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  31.05 
 
 		 511 aa  134  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  35.52 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  34.81 
 
 		 372 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  35.52 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  37.1 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  27.92 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  31.21 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  29.93 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  29.93 
 
 		 1066 aa  57.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.83 
 
 		 1831 aa  56.6  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  27.56 
 
 		 521 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  27.43 
 
 		 1300 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09320  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 1054 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.75 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  27.75 
 
 		 750 aa  47.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  29.1 
 
 		 251 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  28.48 
 
 		 230 aa  43.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>