17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0377 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 550 aa  1107    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  31.13 
 
 		 679 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1214  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.31 
 
 		 785 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1091  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.81 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 1300 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05875  Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin  27.05 
 
 		 956 aa  60.5  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31.58 
 
 		 1831 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  32.96 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  31.54 
 
 		 547 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  26.62 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  30.14 
 
 		 372 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  30.95 
 
 		 521 aa  47  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  32.71 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  25.17 
 
 		 702 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  28.06 
 
 		 511 aa  43.5  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>