170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4085 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  100 
 
 		 547 aa  1098    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0106  flagellin domain protein  41.58 
 
 		 272 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.298157  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0087  flagellin domain protein  40.8 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.01522e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3746  flagellin domain protein  41.09 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1762  flagellin domain protein  40.8 
 
 		 272 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3830  flagellin domain protein  45.96 
 
 		 272 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0123845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2486  flagellin domain protein  39.3 
 
 		 272 aa  130  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3371  flagellin domain protein  46.76 
 
 		 275 aa  125  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0467531  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3332  flagellin domain-containing protein  45 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3370  flagellin domain protein  44.29 
 
 		 275 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0519137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2858  flagellin-like  36.96 
 
 		 289 aa  90.5  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00447179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1105  hypothetical protein  40.32 
 
 		 536 aa  87  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0838477  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3800  flagellin  45.83 
 
 		 886 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1104  hypothetical protein  45.83 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.926496  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4438  flagellin  45.83 
 
 		 886 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1490  flagellin  45.83 
 
 		 753 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3880  flagellin hook IN repeat protein  45.26 
 
 		 1562 aa  84  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.411065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0686  flagellin hook IN repeat-containing protein  45.26 
 
 		 692 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.153449  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5528  putative flagellin protein, C-terminus  46.24 
 
 		 514 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.757214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0522  hypothetical protein  43.88 
 
 		 522 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0559459  normal  0.932507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1336  hypothetical protein  45.26 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2552  hypothetical protein  43.75 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1246  hypothetical protein  42.48 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.905349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2500  hypothetical protein  44.21 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3020  hypothetical protein  44.21 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762369  normal  0.12294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1488  flagellin  43.16 
 
 		 735 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.723636  normal  0.726949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5530  putative flagellin protein, C-terminus  42.86 
 
 		 516 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1194  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  43.24 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.206866  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5762  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.21 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1337  hypothetical protein  37.9 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1408  hypothetical protein  42.48 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.114857 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6415  hypothetical protein  43.16 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1247  hypothetical protein  42.48 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.933518 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0543  flagellin hook IN repeat-containing protein  45.26 
 
 		 693 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2995  hypothetical protein  43.16 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2501  hypothetical protein  43.16 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0238  conserved hypothetical protein; putative flagellin C-ter domain  44.66 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2551  putative flagellin protein, C-terminus  44.33 
 
 		 375 aa  80.1  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.345131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2370  flagellin  44.21 
 
 		 737 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  35.52 
 
 		 521 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6936  hypothetical protein  42.2 
 
 		 620 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1193  hypothetical protein  41.82 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.267898  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5088  hypothetical protein  40.54 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.937332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1489  flagellin  41.94 
 
 		 746 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.671791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7243  hypothetical protein  42.72 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3814  flagellin  36.84 
 
 		 888 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2012  hypothetical protein  40.19 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.999486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4452  flagellin  40.37 
 
 		 888 aa  77  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.438814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2540  flagellin  35.34 
 
 		 892 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1670  flagellin  34.56 
 
 		 762 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.940906  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5527  putative flagellin protein, C-terminus  41.76 
 
 		 523 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  34.78 
 
 		 1831 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0992  flagellin domain protein  30.47 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  29.03 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  31.82 
 
 		 1300 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  32.84 
 
 		 430 aa  57  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 		 645 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 		 550 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 		 350 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.33 
 
 		 647 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  23.33 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3292  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  54.3  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  36.07 
 
 		 511 aa  53.9  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 		 233 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  24.84 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  27.52 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0750  flagella associated protein  40.85 
 
 		 320 aa  52  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  26.85 
 
 		 516 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5667  flagellin domain protein  34.51 
 
 		 302 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 		 372 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3618  flagellin  25.93 
 
 		 283 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000440531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  25 
 
 		 372 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  25.62 
 
 		 389 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0034  flagellin domain protein  36.14 
 
 		 292 aa  51.2  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  26.13 
 
 		 389 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  27.19 
 
 		 290 aa  50.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0329  flagellin domain protein  36.08 
 
 		 302 aa  50.8  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0751  flagella associated protein  38.1 
 
 		 320 aa  50.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2534  flagellin-like  29.36 
 
 		 298 aa  50.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0328  flagellin domain protein  36.14 
 
 		 301 aa  50.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.281136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  26.23 
 
 		 294 aa  50.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  25.93 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  25.93 
 
 		 384 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  26.23 
 
 		 299 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0749  flagella associated protein  39.13 
 
 		 320 aa  50.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0362  flagellin domain protein  26.22 
 
 		 303 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00825341  normal  0.202796 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3922  flagellin domain protein  39.13 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172476  normal  0.265134 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  28.07 
 
 		 314 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0361  flagellin domain protein  34.02 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0478487  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  32.84 
 
 		 372 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  25.23 
 
 		 799 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  24.39 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0267  flagellin domain-containing protein  34.44 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  24.39 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2884  flagellin domain-containing protein  33.73 
 
 		 279 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.134875  normal  0.076703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  27.27 
 
 		 273 aa  48.9  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0360  flagellin domain protein  36.14 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00664833  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6612  flagellin domain protein  39.44 
 
 		 302 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0826615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0268  flagellin domain-containing protein  32.89 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4247  flagellin domain protein  40.58 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.157058 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>