10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1107 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1107  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  846    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1382  hypothetical protein  67.23 
 
 		 412 aa  561  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404112  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0961  hypothetical protein  65.45 
 
 		 413 aa  556  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1233  hypothetical protein  65.78 
 
 		 414 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0143332  normal  0.037479 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1559  hypothetical protein  64.27 
 
 		 409 aa  528  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.158764  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01915  hypothetical protein  45.75 
 
 		 390 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  27.76 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  27.07 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  24.36 
 
 		 430 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>