21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0100 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  100 
 
 
350 aa  703    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  47.75 
 
 
349 aa  325  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 
645 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  34.27 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  33.88 
 
 
1300 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  35.16 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 
372 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 
550 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  29.37 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  26.29 
 
 
227 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  30 
 
 
547 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  28.99 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  27.27 
 
 
1831 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 
233 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  25.11 
 
 
511 aa  50.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  29.91 
 
 
369 aa  47  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  27.41 
 
 
251 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 
542 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  22.76 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1029  hypothetical protein  45 
 
 
94 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220701  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>