25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3123 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 1300 aa  2658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.14 
 
 		 1831 aa  193  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  32.37 
 
 		 521 aa  82  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  33.88 
 
 		 350 aa  70.5  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  28.29 
 
 		 372 aa  69.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  36.79 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 		 349 aa  66.2  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 372 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  30.83 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  31.37 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  34.68 
 
 		 227 aa  61.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 		 550 aa  60.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  33.07 
 
 		 251 aa  60.1  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 		 233 aa  59.3  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  31.82 
 
 		 547 aa  54.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.14 
 
 		 647 aa  54.3  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  27.53 
 
 		 1066 aa  54.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  32.74 
 
 		 251 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1500  hypothetical protein  33.88 
 
 		 348 aa  50.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0381829 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  28.93 
 
 		 430 aa  49.7  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  25.29 
 
 		 458 aa  48.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  48.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09320  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 		 1054 aa  48.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  26.55 
 
 		 511 aa  46.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>