16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2737 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  100 
 
 
233 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  50.44 
 
 
251 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  45.18 
 
 
230 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  40.89 
 
 
227 aa  198  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 
1300 aa  59.3  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  30.99 
 
 
547 aa  53.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 
350 aa  52  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  27.85 
 
 
702 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  25.44 
 
 
380 aa  46.2  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 
372 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  30.53 
 
 
521 aa  46.2  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 
349 aa  45.1  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  26.09 
 
 
430 aa  45.1  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
372 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1028  hypothetical protein  34.57 
 
 
161 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115151  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.1 
 
 
1831 aa  42  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>