29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1501 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 349 aa  706    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  47.75 
 
 		 350 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  28.66 
 
 		 645 aa  66.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 		 1300 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  31.93 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  30.71 
 
 		 1831 aa  57.8  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 550 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  30 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  25.2 
 
 		 430 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09320  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 1054 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  30.26 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1500  hypothetical protein  34.13 
 
 		 348 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0381829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 		 665 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1842  hypothetical protein  28 
 
 		 653 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  25.75 
 
 		 702 aa  50.4  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  31.3 
 
 		 251 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 		 542 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  23.81 
 
 		 380 aa  46.2  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3873  PpkA-related protein  23.35 
 
 		 631 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  23.84 
 
 		 1066 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3417  Serine/threonine protein kinase-like protein  23.35 
 
 		 629 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.996325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3135  ppkA-related protein  23.35 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  30.2 
 
 		 227 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  23.35 
 
 		 458 aa  44.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0467  von Willebrand factor type A  24.8 
 
 		 659 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>