16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0599 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  520  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  56.7 
 
 
227 aa  270  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  54.82 
 
 
230 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  50.44 
 
 
233 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  38.41 
 
 
1831 aa  63.5  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  33.07 
 
 
1300 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  27.78 
 
 
430 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  29.1 
 
 
458 aa  47.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  27.41 
 
 
350 aa  46.6  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  30.15 
 
 
372 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  21.28 
 
 
380 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  27.52 
 
 
542 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  29.37 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  30.88 
 
 
547 aa  44.3  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1670  von Willebrand factor type A  23.61 
 
 
702 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.423007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>