29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0146 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0146  hyalin  100 
 
 		 521 aa  1028    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.47 
 
 		 647 aa  242  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  36.46 
 
 		 1066 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  32.69 
 
 		 1300 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  34.08 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  36.07 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1500  hypothetical protein  30.04 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0381829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  28.75 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 645 aa  62  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3517  hyalin  44.58 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  30.33 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  48.57 
 
 		 912 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31.62 
 
 		 1831 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  29.87 
 
 		 380 aa  55.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  27.56 
 
 		 458 aa  54.3  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0123  von Willebrand factor type A  33.11 
 
 		 491 aa  53.9  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0626455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2074  Hyalin  42.17 
 
 		 613 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1989  Hyalin  42.17 
 
 		 610 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.160396  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  33.06 
 
 		 372 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  30.95 
 
 		 372 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  29.12 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  31.45 
 
 		 372 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  31.87 
 
 		 3089 aa  50.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 		 550 aa  47  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0873  PGAP1 family protein  36.14 
 
 		 1257 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.730318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  29.46 
 
 		 227 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2737  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 		 233 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.348015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1856  hyalin  38.96 
 
 		 256 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.971328 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  23.35 
 
 		 542 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>