32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0106 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1000    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  29.34 
 
 		 458 aa  152  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  39.88 
 
 		 372 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  40 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  38.86 
 
 		 372 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  38.71 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  32.67 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  32.12 
 
 		 369 aa  72.8  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.76 
 
 		 647 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  36.21 
 
 		 1831 aa  70.5  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  38.1 
 
 		 1066 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  31.36 
 
 		 251 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  25.56 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  30.86 
 
 		 521 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 		 1300 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  24.81 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  36.07 
 
 		 547 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0377  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 550 aa  54.7  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01915  hypothetical protein  22.4 
 
 		 390 aa  53.9  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  31.71 
 
 		 645 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  29.32 
 
 		 227 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  31.25 
 
 		 663 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1233  hypothetical protein  19.4 
 
 		 414 aa  48.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0143332  normal  0.037479 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09320  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 		 1054 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3219  hypothetical protein  25.97 
 
 		 632 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.369391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1316  PpkA-related protein  26.4 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  29.93 
 
 		 230 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.68 
 
 		 701 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  32.06 
 
 		 251 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  25 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0961  hypothetical protein  23.39 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3151  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 665 aa  43.5  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.400285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>