26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0231 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0231  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209293  normal  0.107963 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0194  hypothetical protein  26.83 
 
 
380 aa  82  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00240  expressed protein  32.5 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0146  hyalin  36.07 
 
 
521 aa  73.6  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.68 
 
 
1831 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0100  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.29 
 
 
647 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0941  hypothetical protein  31.21 
 
 
458 aa  64.3  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.0000000894355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  30.53 
 
 
1066 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0133  von Willebrand factor, type A  30.51 
 
 
372 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1501  von Willebrand factor, type A  31.93 
 
 
349 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.960229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0716  von Willebrand factor, type A  30.51 
 
 
372 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1500  hypothetical protein  29.17 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0381829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0572  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 
372 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0329  hypothetical protein  28.68 
 
 
369 aa  56.2  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.289626  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0106  hypothetical protein  31.36 
 
 
511 aa  56.2  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2181  von Willebrand factor type A  25.9 
 
 
542 aa  54.7  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0341123  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3123  von Willebrand factor, type A  32.74 
 
 
1300 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4085  flagellin domain protein  28.93 
 
 
547 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09320  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 
1054 aa  46.2  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.581955  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0489  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 
645 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31991  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0599  hypothetical protein  29.37 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5138  hypothetical protein  31.15 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0300874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3949  hypothetical protein  28.57 
 
 
318 aa  43.5  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1382  hypothetical protein  26.67 
 
 
412 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0404112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3508  hypothetical protein  30.69 
 
 
230 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.694893  normal  0.195656 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>