148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3922 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  100 
 
 		 701 aa  1452    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  44.44 
 
 		 755 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  36.73 
 
 		 789 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  40.87 
 
 		 791 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  39.15 
 
 		 750 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.87 
 
 		 770 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  40.03 
 
 		 794 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  38.01 
 
 		 755 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.69 
 
 		 755 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.41 
 
 		 751 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.64 
 
 		 759 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  37.31 
 
 		 739 aa  409  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.48 
 
 		 722 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  36.45 
 
 		 757 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.25 
 
 		 772 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.46 
 
 		 771 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  37.46 
 
 		 771 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  35.63 
 
 		 760 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.86 
 
 		 763 aa  398  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.63 
 
 		 772 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.1 
 
 		 776 aa  388  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  35.24 
 
 		 761 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.73 
 
 		 712 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.84 
 
 		 740 aa  362  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.74 
 
 		 723 aa  360  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.76 
 
 		 725 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.74 
 
 		 732 aa  344  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.37 
 
 		 738 aa  342  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.83 
 
 		 729 aa  329  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  32.2 
 
 		 753 aa  329  9e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.25 
 
 		 786 aa  327  5e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.69 
 
 		 1362 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  28.73 
 
 		 819 aa  263  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.94 
 
 		 812 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.24 
 
 		 701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.32 
 
 		 671 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.6 
 
 		 691 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  27.18 
 
 		 711 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.73 
 
 		 831 aa  203  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.94 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  26.85 
 
 		 776 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  27.02 
 
 		 774 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.69 
 
 		 1033 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  27.06 
 
 		 796 aa  177  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.81 
 
 		 833 aa  150  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.15 
 
 		 775 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 		 840 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  22.86 
 
 		 713 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  27.84 
 
 		 1109 aa  107  5e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.33 
 
 		 680 aa  104  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.78 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 592 aa  75.1  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.39 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 		 418 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 		 418 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  26.39 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.6 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.23 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 		 625 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  24.34 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.88 
 
 		 575 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.29 
 
 		 588 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 624 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.49 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  25.35 
 
 		 708 aa  57.8  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.91 
 
 		 418 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.42 
 
 		 621 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  25.58 
 
 		 651 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  25.58 
 
 		 651 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  24.88 
 
 		 642 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 462 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  27.62 
 
 		 536 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  25.35 
 
 		 633 aa  55.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 		 430 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 		 642 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  23.96 
 
 		 625 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 		 627 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  24.73 
 
 		 418 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.27 
 
 		 426 aa  54.7  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1120 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 		 613 aa  54.3  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  25.34 
 
 		 686 aa  54.3  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.57 
 
 		 412 aa  54.3  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  24.07 
 
 		 640 aa  54.3  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  25.59 
 
 		 792 aa  54.3  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  23.08 
 
 		 563 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.13 
 
 		 412 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  24.54 
 
 		 639 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 		 412 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.48 
 
 		 808 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>