111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5161 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  55.67 
 
 
755 aa  676    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  64.95 
 
 
732 aa  735    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 
729 aa  1405    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  66.26 
 
 
761 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  63.78 
 
 
723 aa  731    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  64.47 
 
 
738 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  66.82 
 
 
725 aa  749    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  49.62 
 
 
750 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  50.82 
 
 
791 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  49.51 
 
 
794 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  46.65 
 
 
755 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  47.05 
 
 
740 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  34.99 
 
 
763 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.31 
 
 
712 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.59 
 
 
771 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.46 
 
 
772 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.31 
 
 
770 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  35.61 
 
 
739 aa  379  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  37.48 
 
 
771 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.03 
 
 
772 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  37.16 
 
 
757 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  32.49 
 
 
789 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.27 
 
 
755 aa  369  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.51 
 
 
751 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  35.16 
 
 
701 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.91 
 
 
759 aa  361  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.15 
 
 
776 aa  360  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.45 
 
 
722 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  37.29 
 
 
760 aa  350  7e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.19 
 
 
1362 aa  320  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.51 
 
 
786 aa  309  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  34.94 
 
 
753 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.72 
 
 
819 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.66 
 
 
691 aa  250  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  33.06 
 
 
711 aa  249  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.9 
 
 
701 aa  244  5e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.79 
 
 
795 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  34.3 
 
 
774 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.89 
 
 
812 aa  238  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  33.02 
 
 
831 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  33.99 
 
 
796 aa  234  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.96 
 
 
1033 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.39 
 
 
671 aa  192  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.11 
 
 
776 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 
775 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  30.02 
 
 
833 aa  107  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 
840 aa  103  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.76 
 
 
680 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  28.71 
 
 
713 aa  89.7  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.13 
 
 
1109 aa  81.6  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  32.49 
 
 
412 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 
415 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.09 
 
 
418 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  33.13 
 
 
412 aa  64.7  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 
418 aa  63.5  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  20.79 
 
 
338 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  37.4 
 
 
543 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 
423 aa  61.6  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 
416 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  32.72 
 
 
425 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 
546 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  32.1 
 
 
425 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
412 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
479 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 
547 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  31.5 
 
 
1120 aa  55.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 
412 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.11 
 
 
442 aa  53.9  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.13 
 
 
412 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 
421 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.87 
 
 
418 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  31.29 
 
 
828 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  32.31 
 
 
942 aa  52.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
393 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  29.44 
 
 
847 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  23.62 
 
 
462 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
464 aa  51.2  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 
918 aa  51.2  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 
903 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
411 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  28.85 
 
 
744 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 
1077 aa  50.1  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.54 
 
 
420 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  31.41 
 
 
561 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  30.12 
 
 
419 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 
958 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 
467 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 
419 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
418 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
419 aa  48.9  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 
418 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
418 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  27.55 
 
 
851 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  31.41 
 
 
562 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
717 aa  47.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  33.61 
 
 
523 aa  47.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  23.29 
 
 
427 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  29.58 
 
 
441 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0123  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
491 aa  46.6  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0626455  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 
615 aa  45.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>