203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0477 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
571 aa  1168    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  51.68 
 
 
566 aa  509  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.46 
 
 
563 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  44.46 
 
 
588 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  45.01 
 
 
627 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  43.81 
 
 
642 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  50.43 
 
 
575 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  43.31 
 
 
642 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  50.43 
 
 
575 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  50.94 
 
 
598 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  50.73 
 
 
593 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  42.81 
 
 
642 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  47.52 
 
 
536 aa  455  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  43.64 
 
 
613 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  47.49 
 
 
624 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  47.49 
 
 
625 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  41.44 
 
 
633 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  46.49 
 
 
621 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  47.84 
 
 
640 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  46.49 
 
 
639 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  47.47 
 
 
708 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  41.72 
 
 
612 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  43.93 
 
 
625 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  45.04 
 
 
613 aa  424  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  44.97 
 
 
651 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  44.7 
 
 
592 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  44.14 
 
 
686 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  44.11 
 
 
651 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  43.81 
 
 
698 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  41.67 
 
 
706 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  44.96 
 
 
792 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  43.64 
 
 
555 aa  397  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  45.17 
 
 
709 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  44.56 
 
 
551 aa  385  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  42.12 
 
 
654 aa  362  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  54.31 
 
 
350 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  39.6 
 
 
629 aa  323  7e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  44.35 
 
 
555 aa  300  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  36.12 
 
 
610 aa  295  2e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  38.96 
 
 
588 aa  288  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  35.16 
 
 
500 aa  233  6e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  36.14 
 
 
490 aa  229  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  31.05 
 
 
859 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  33.14 
 
 
935 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.94 
 
 
451 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.6 
 
 
460 aa  104  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 
472 aa  104  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.6 
 
 
472 aa  103  7e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.47 
 
 
462 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.27 
 
 
442 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
412 aa  93.2  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 
411 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 
423 aa  90.9  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 
425 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 
416 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 
425 aa  87  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  31.02 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
808 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27 
 
 
479 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.96 
 
 
459 aa  85.9  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 
418 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 
418 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.94 
 
 
418 aa  84  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 
615 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 
415 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.26 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 
936 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  34.88 
 
 
523 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 
561 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 
589 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  23.66 
 
 
420 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 
423 aa  73.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.1 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  21.56 
 
 
816 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.75 
 
 
701 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  28.34 
 
 
932 aa  70.5  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  23.29 
 
 
958 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 
523 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 
505 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 
419 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 
426 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
914 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  21.4 
 
 
602 aa  64.3  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.67 
 
 
691 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.78 
 
 
701 aa  63.9  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  26.26 
 
 
757 aa  63.9  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.92 
 
 
755 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
903 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.98 
 
 
759 aa  62.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.54 
 
 
751 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.37 
 
 
427 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  23.53 
 
 
446 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  23.76 
 
 
480 aa  61.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>