165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01616 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  100 
 
 		 350 aa  707    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  56.69 
 
 		 566 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  54.99 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  53.22 
 
 		 536 aa  348  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  53.82 
 
 		 571 aa  343  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  53.87 
 
 		 640 aa  341  9e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  52.82 
 
 		 639 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  50 
 
 		 613 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  53.64 
 
 		 588 aa  331  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  52.35 
 
 		 621 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  52.68 
 
 		 633 aa  329  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  50.85 
 
 		 625 aa  329  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  50.46 
 
 		 625 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  53.69 
 
 		 575 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  50.15 
 
 		 624 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  53.69 
 
 		 575 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  52.96 
 
 		 598 aa  325  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  52.43 
 
 		 642 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  51.83 
 
 		 613 aa  324  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  52.43 
 
 		 627 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  52.63 
 
 		 593 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  52.43 
 
 		 642 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  49.51 
 
 		 709 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  51.78 
 
 		 642 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  53.08 
 
 		 551 aa  316  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  50.62 
 
 		 706 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  52.19 
 
 		 698 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  49.66 
 
 		 612 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  47.57 
 
 		 792 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  48.08 
 
 		 592 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  52.01 
 
 		 555 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  48.85 
 
 		 708 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  49.84 
 
 		 654 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  47.4 
 
 		 651 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  47.84 
 
 		 651 aa  278  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  47.32 
 
 		 555 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  47.14 
 
 		 686 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  46.41 
 
 		 629 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  42.45 
 
 		 588 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  39.82 
 
 		 610 aa  230  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  36.07 
 
 		 500 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  37.46 
 
 		 490 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  42.42 
 
 		 935 aa  132  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 		 859 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 462 aa  97.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.84 
 
 		 416 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  35.05 
 
 		 412 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.85 
 
 		 451 aa  93.6  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.11 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.11 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.26 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.11 
 
 		 472 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.94 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.96 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  32.49 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.72 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  34.42 
 
 		 523 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.32 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 615 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  33.53 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.84 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  31.76 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 		 425 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  23.73 
 
 		 602 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.18 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.71 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  24.14 
 
 		 523 aa  62.8  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.08 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  28.12 
 
 		 318 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 		 573 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 		 1188 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  29.88 
 
 		 327 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  30 
 
 		 669 aa  53.9  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  27.71 
 
 		 932 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.85 
 
 		 671 aa  53.5  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 546 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30 
 
 		 680 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  25.11 
 
 		 816 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 		 936 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2889  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  36 
 
 		 653 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 589 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.13 
 
 		 701 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>