109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1077 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  56.22 
 
 		 621 aa  638    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  55.83 
 
 		 624 aa  651    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  56.16 
 
 		 625 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 612 aa  1256    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  56.47 
 
 		 613 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  61.09 
 
 		 642 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  56.83 
 
 		 633 aa  656    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  61.39 
 
 		 642 aa  653    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  61.28 
 
 		 642 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  61.58 
 
 		 640 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  61.21 
 
 		 627 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  51.77 
 
 		 566 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  52.27 
 
 		 563 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  50.83 
 
 		 708 aa  465  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  46.83 
 
 		 625 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  47.19 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  46.76 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  46.79 
 
 		 686 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  41.67 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  47.61 
 
 		 651 aa  432  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  46.99 
 
 		 651 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  44.7 
 
 		 706 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  47.34 
 
 		 639 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  46.22 
 
 		 536 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  46.09 
 
 		 592 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  44.61 
 
 		 698 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  43.3 
 
 		 709 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  40.4 
 
 		 598 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  39.17 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  44.68 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  37.23 
 
 		 588 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  44.7 
 
 		 654 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  44.95 
 
 		 792 aa  398  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  42.06 
 
 		 575 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.06 
 
 		 575 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  38.83 
 
 		 629 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  38.74 
 
 		 555 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  49.66 
 
 		 350 aa  303  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  38.44 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  36.8 
 
 		 610 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  38.67 
 
 		 490 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  36.97 
 
 		 500 aa  229  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 		 859 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  35.67 
 
 		 935 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  31.34 
 
 		 425 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.34 
 
 		 460 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 		 425 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  27.34 
 
 		 472 aa  94.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.17 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.95 
 
 		 472 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  33.85 
 
 		 462 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  33.16 
 
 		 615 aa  87.4  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.02 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  29.6 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.1 
 
 		 442 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  23.45 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.86 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  24.51 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 418 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 592 aa  67.8  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.63 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01615  hypothetical protein  43.59 
 
 		 86 aa  66.6  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  30.91 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  20.25 
 
 		 602 aa  63.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.81 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 427 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 		 418 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  28.87 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 1188 aa  57.4  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.51 
 
 		 419 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 		 914 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 412 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  30.46 
 
 		 744 aa  52  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 		 380 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  23.14 
 
 		 452 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  21.89 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 452 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 		 966 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  32.97 
 
 		 92 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  21.2 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 423 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 		 842 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.45 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.59 
 
 		 760 aa  47.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 467 aa  47.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.72 
 
 		 643 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  27.37 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.155283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>