132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2520 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 452 aa  873    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  81.19 
 
 		 452 aa  639    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  43.49 
 
 		 446 aa  293  4e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  32.53 
 
 		 455 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  30.66 
 
 		 467 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 		 419 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.93 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 419 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 425 aa  97.1  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  26.73 
 
 		 464 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  33 
 
 		 441 aa  90.1  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.04 
 
 		 479 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  25.5 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.66 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.03 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.98 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  24.78 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.1 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.51 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.42 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.17 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  22.65 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  33.8 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.57 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 		 640 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  26.58 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 613 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.45 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  30.32 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  23.24 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.32 
 
 		 621 aa  63.5  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.1 
 
 		 602 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  32.62 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29 
 
 		 1188 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  31.91 
 
 		 624 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  34 
 
 		 490 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.79 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.79 
 
 		 588 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 610 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 562 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  29.48 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  29.45 
 
 		 792 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  24.52 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  28.03 
 
 		 633 aa  54.3  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  22.65 
 
 		 356 aa  53.9  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  35.17 
 
 		 339 aa  53.9  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  26.58 
 
 		 570 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 566 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 639 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 592 aa  53.1  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.57 
 
 		 629 aa  53.1  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 		 307 aa  53.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  30.39 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.45 
 
 		 327 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0335  von Willebrand factor, type A  26.38 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  39.45 
 
 		 329 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  25.15 
 
 		 709 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 423 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  25.35 
 
 		 625 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 325 aa  50.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 		 430 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 808 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  30.81 
 
 		 337 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  32.71 
 
 		 333 aa  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  27.5 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  31.72 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 612 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  27.74 
 
 		 350 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  32.39 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  31.69 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  24.55 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.03 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 		 338 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1318  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598912  normal  0.213186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24400  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.81 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0690216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 		 338 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 847 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  24.55 
 
 		 598 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>