83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_A0004 on replicon NC_007411
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
464 aa  944    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  57.45 
 
 
441 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  46.77 
 
 
467 aa  418  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  30.53 
 
 
419 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 
420 aa  170  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.21 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
418 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.06 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  26.73 
 
 
452 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.99 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  24.15 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  31.06 
 
 
446 aa  84.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  24.73 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.1 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.71 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  23.1 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  24.59 
 
 
426 aa  70.5  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  23.54 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
421 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
430 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  22.1 
 
 
418 aa  67  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  23.9 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.74 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 
419 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.87 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 
903 aa  60.1  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 
966 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  25.87 
 
 
842 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 
847 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  24.42 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  22.82 
 
 
476 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.01 
 
 
505 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  27.98 
 
 
490 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 
792 aa  56.6  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  26.8 
 
 
566 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  22.87 
 
 
615 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  25.58 
 
 
851 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 
654 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
918 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 
808 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 
828 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27 
 
 
472 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.95 
 
 
3027 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.96 
 
 
1188 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.16 
 
 
460 aa  50.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.16 
 
 
472 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  26.11 
 
 
717 aa  50.1  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  27 
 
 
686 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
950 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
888 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  30.06 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 
972 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 
479 aa  47.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 
914 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4403  von Willebrand factor type A  21.07 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239793  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  26.22 
 
 
598 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  26.22 
 
 
593 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.68 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 
411 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  27.6 
 
 
651 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.58 
 
 
729 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 
651 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  23.71 
 
 
701 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  21.72 
 
 
640 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 
536 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  21.61 
 
 
462 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  24.62 
 
 
592 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  22.34 
 
 
571 aa  44.3  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2532  von Willebrand factor type A  23.16 
 
 
464 aa  44.3  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 
474 aa  44.3  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  26.05 
 
 
951 aa  43.5  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 
639 aa  43.5  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.38 
 
 
350 aa  43.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  24.38 
 
 
440 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  26.26 
 
 
610 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
642 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>