125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17360 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  100 
 
 
629 aa  1278    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  61.32 
 
 
555 aa  555  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  49.59 
 
 
551 aa  450  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  48.28 
 
 
536 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  45.73 
 
 
709 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  44.47 
 
 
625 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  45.29 
 
 
613 aa  373  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  43.4 
 
 
639 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  44.55 
 
 
640 aa  363  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  40.98 
 
 
792 aa  353  5.9999999999999994e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  44.06 
 
 
613 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  38.98 
 
 
563 aa  350  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  43.84 
 
 
625 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  43.61 
 
 
624 aa  345  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  42.64 
 
 
633 aa  343  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  42.92 
 
 
621 aa  342  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  41.75 
 
 
642 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  41.75 
 
 
627 aa  340  7e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  41.75 
 
 
642 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  45.41 
 
 
566 aa  335  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  41.14 
 
 
642 aa  333  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  44.67 
 
 
698 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  43.78 
 
 
706 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  39.91 
 
 
571 aa  323  5e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  42.42 
 
 
686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  43.19 
 
 
651 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  38.83 
 
 
612 aa  319  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  42.73 
 
 
651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  43.35 
 
 
708 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  39.09 
 
 
598 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.25 
 
 
588 aa  307  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  38.75 
 
 
593 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  42.03 
 
 
592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  39.59 
 
 
575 aa  301  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.59 
 
 
575 aa  301  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  40.64 
 
 
555 aa  296  9e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  41.67 
 
 
654 aa  293  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  36.96 
 
 
588 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  46.41 
 
 
350 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  36.92 
 
 
610 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  35.37 
 
 
500 aa  218  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  36.32 
 
 
490 aa  214  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  32.66 
 
 
859 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  36.42 
 
 
935 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 
808 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 
416 aa  87.4  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  34.5 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
462 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  24.23 
 
 
425 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  24.74 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.49 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 
958 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  24.29 
 
 
615 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 
523 aa  66.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.77 
 
 
451 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.39 
 
 
460 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  23.71 
 
 
423 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.63 
 
 
479 aa  64.3  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  24.39 
 
 
472 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.39 
 
 
472 aa  63.9  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
411 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.45 
 
 
442 aa  63.5  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 
418 aa  60.5  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  23.66 
 
 
602 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  25.12 
 
 
816 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 
427 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  25.37 
 
 
421 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.17 
 
 
412 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.32 
 
 
755 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.75 
 
 
680 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  25.57 
 
 
966 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.32 
 
 
759 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 
426 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.15 
 
 
459 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  24.66 
 
 
505 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.29 
 
 
712 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  26.71 
 
 
415 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.83 
 
 
751 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 
421 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
480 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  24.28 
 
 
592 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.8 
 
 
760 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  24.57 
 
 
452 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
412 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.04 
 
 
794 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  24.64 
 
 
420 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  24.02 
 
 
452 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
419 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.7 
 
 
772 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  25.13 
 
 
950 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  24.29 
 
 
441 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.32 
 
 
671 aa  50.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  24.6 
 
 
771 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  26.9 
 
 
393 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  25.47 
 
 
423 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>