125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6907 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 588 aa  1212    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  42.16 
 
 		 639 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  44.07 
 
 		 613 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  41.46 
 
 		 625 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  48.15 
 
 		 536 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  45.79 
 
 		 709 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  43.58 
 
 		 792 aa  389  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  41.18 
 
 		 563 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  41.78 
 
 		 566 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  42.15 
 
 		 551 aa  349  6e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  42.74 
 
 		 642 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  42.74 
 
 		 627 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  42.4 
 
 		 642 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  42.52 
 
 		 642 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  40.83 
 
 		 625 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.88 
 
 		 621 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  42.26 
 
 		 633 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  40.69 
 
 		 698 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  41.06 
 
 		 613 aa  337  5e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  40.61 
 
 		 624 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  42.26 
 
 		 640 aa  329  7e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  39.7 
 
 		 706 aa  329  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  38.44 
 
 		 612 aa  319  7e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  38.79 
 
 		 651 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  39.01 
 
 		 651 aa  319  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  38.96 
 
 		 571 aa  317  4e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  37.19 
 
 		 598 aa  313  5.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  38.41 
 
 		 592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  36.48 
 
 		 593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.39 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  37.42 
 
 		 708 aa  300  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  38.15 
 
 		 575 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  38.15 
 
 		 575 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  37.76 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  39.21 
 
 		 654 aa  298  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  37.61 
 
 		 629 aa  296  8e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  39.39 
 
 		 555 aa  295  1e-78  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  42.45 
 
 		 350 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  36.71 
 
 		 686 aa  270  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  35.78 
 
 		 610 aa  264  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  34.04 
 
 		 500 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  33.64 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  28.18 
 
 		 859 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  40.24 
 
 		 935 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.82 
 
 		 451 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.86 
 
 		 460 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 		 472 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.5 
 
 		 472 aa  93.2  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.25 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.11 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  32.51 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 		 425 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.4 
 
 		 459 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 808 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.52 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  31.5 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.16 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  30.33 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  31.22 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.28 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 		 427 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  24.41 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  28.32 
 
 		 441 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  28.48 
 
 		 419 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 430 aa  54.3  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.94 
 
 		 680 aa  53.9  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  23.4 
 
 		 932 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 505 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1437  magnesium chelatase ATPase subunit D  27.17 
 
 		 619 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000286805  normal  0.499539 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 		 307 aa  52.8  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 		 420 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 		 562 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  24.39 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.65 
 
 		 412 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 936 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.44 
 
 		 419 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.84 
 
 		 620 aa  50.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  32.58 
 
 		 92 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.14 
 
 		 618 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  28.99 
 
 		 346 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 344 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.41 
 
 		 621 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3122  magnesium chelatase ATPase subunit D  29.38 
 
 		 636 aa  47.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  29.94 
 
 		 637 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.12 
 
 		 561 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  31.4 
 
 		 523 aa  47.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>