107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0325 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  100 
 
 
859 aa  1709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  33.92 
 
 
610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  32.01 
 
 
651 aa  204  7e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  31.57 
 
 
651 aa  201  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
563 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  30.34 
 
 
612 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  34.15 
 
 
490 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  34.12 
 
 
639 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
592 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  32.66 
 
 
629 aa  191  4e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 
625 aa  190  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  33.63 
 
 
640 aa  188  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  32.86 
 
 
633 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.34 
 
 
621 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  29.12 
 
 
536 aa  185  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  29.98 
 
 
627 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  32.76 
 
 
613 aa  183  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 
709 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  29.74 
 
 
642 aa  183  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  33.63 
 
 
566 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  29.48 
 
 
642 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  30.96 
 
 
654 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 
571 aa  181  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  32.48 
 
 
625 aa  181  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  32.19 
 
 
624 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  28.73 
 
 
593 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 
500 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  28.7 
 
 
708 aa  179  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 
613 aa  179  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  28.04 
 
 
598 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  33.24 
 
 
792 aa  177  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  29.04 
 
 
642 aa  177  8e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  29.75 
 
 
706 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 
698 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  30.7 
 
 
686 aa  173  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  31.61 
 
 
555 aa  169  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.44 
 
 
588 aa  167  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  30.02 
 
 
555 aa  163  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
551 aa  162  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  26.37 
 
 
575 aa  161  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.37 
 
 
575 aa  161  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  27.99 
 
 
588 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  29.9 
 
 
350 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.49 
 
 
442 aa  88.6  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 
808 aa  84.7  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 
411 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.3 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.2 
 
 
451 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.55 
 
 
416 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 
462 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.53 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  26.87 
 
 
816 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  25.2 
 
 
602 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.83 
 
 
479 aa  64.7  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.88 
 
 
460 aa  62.4  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  23.68 
 
 
472 aa  61.6  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 
421 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.06 
 
 
472 aa  60.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  24.2 
 
 
418 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  24.2 
 
 
418 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3412  von Willebrand factor, type A  34.59 
 
 
456 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0316076  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
425 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  25.99 
 
 
523 aa  55.1  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  25 
 
 
425 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.21 
 
 
344 aa  53.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
415 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 
412 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  22.96 
 
 
418 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
421 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
935 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 
430 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.21 
 
 
344 aa  52.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  26.86 
 
 
412 aa  51.6  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.77 
 
 
418 aa  51.6  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  24.22 
 
 
615 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 
426 aa  51.2  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 
480 aa  51.2  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  30.84 
 
 
505 aa  50.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 
903 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.18 
 
 
643 aa  50.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
419 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 
420 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2048  TonB-dependent receptor  43.33 
 
 
929 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.221244  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.94 
 
 
842 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3766  TonB-dependent receptor plug  56.25 
 
 
1146 aa  48.9  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282602  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 
546 aa  48.5  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 
592 aa  48.5  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  30.59 
 
 
914 aa  47.8  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0786  magnesium chelatase ATPase subunit D  32.4 
 
 
620 aa  47.4  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1991  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 
1243 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.302175  normal  0.112109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1795  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.84 
 
 
618 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 
423 aa  47.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.17 
 
 
418 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1620  magnesium chelatase ATPase subunit D  30.77 
 
 
621 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  28.48 
 
 
951 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  28.57 
 
 
313 aa  46.6  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3377  TonB-dependent receptor plug  48.15 
 
 
1314 aa  46.6  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615766  normal  0.66786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1492  magnesium chelatase ATPase subunit D  31.84 
 
 
618 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  20.81 
 
 
423 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>