206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2631 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  100 
 
 
442 aa  882    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  39.74 
 
 
451 aa  299  8e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.97 
 
 
460 aa  289  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  40.97 
 
 
472 aa  289  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.74 
 
 
472 aa  286  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  36.99 
 
 
462 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  43.28 
 
 
412 aa  189  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 
416 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.63 
 
 
615 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  32.13 
 
 
411 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  29.36 
 
 
479 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
430 aa  144  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  36.84 
 
 
459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  33.46 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  32.14 
 
 
421 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.65 
 
 
425 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  31.65 
 
 
425 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  31.58 
 
 
420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  31.38 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 
418 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  33.15 
 
 
412 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 
566 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 
610 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
480 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28 
 
 
423 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  31.16 
 
 
419 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  29.32 
 
 
536 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 
423 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 
571 aa  99.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  35.02 
 
 
563 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  29.71 
 
 
602 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
640 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  32.04 
 
 
633 aa  94.4  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  32.89 
 
 
490 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  30.43 
 
 
598 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  30.43 
 
 
593 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  30.09 
 
 
627 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 
412 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  30.09 
 
 
642 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  31.07 
 
 
642 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.1 
 
 
621 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 
642 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  30.1 
 
 
613 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  36.52 
 
 
903 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  31.6 
 
 
654 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  30.1 
 
 
625 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  30.98 
 
 
859 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  28.71 
 
 
639 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  35.11 
 
 
842 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
624 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  31.48 
 
 
706 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 
418 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
792 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.07 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  28.24 
 
 
698 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.94 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  30.26 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  29.57 
 
 
592 aa  82.8  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  31.29 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
625 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  31.98 
 
 
452 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  33.87 
 
 
966 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  25.32 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  30.38 
 
 
888 aa  80.1  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  26.61 
 
 
575 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  28.1 
 
 
612 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.61 
 
 
575 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.04 
 
 
588 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.08 
 
 
680 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  24.92 
 
 
709 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.04 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
808 aa  77.4  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  27.49 
 
 
551 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  31.72 
 
 
972 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  26.06 
 
 
651 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  32.04 
 
 
951 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  30.49 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 
651 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  25.44 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
847 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  28.91 
 
 
708 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 
588 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  25.36 
 
 
613 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  25.25 
 
 
356 aa  70.5  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
686 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  28.34 
 
 
555 aa  68.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  31.82 
 
 
914 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  32.96 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
918 aa  67  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>