151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1363 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  42.78 
 
 
958 aa  642    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  84.38 
 
 
966 aa  1584    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  100 
 
 
972 aa  1900    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  45.59 
 
 
914 aa  643    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  41.02 
 
 
950 aa  595  1e-168  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  40.05 
 
 
936 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  39.32 
 
 
932 aa  520  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  36.73 
 
 
978 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  33.12 
 
 
951 aa  449  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  33.55 
 
 
918 aa  412  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 
903 aa  331  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 
902 aa  327  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 
828 aa  327  7e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
888 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 
851 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  33.2 
 
 
842 aa  315  2.9999999999999996e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.78 
 
 
847 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  28.12 
 
 
1023 aa  301  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  27.44 
 
 
859 aa  177  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
744 aa  133  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 
717 aa  95.9  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  34.05 
 
 
416 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  36.13 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
788 aa  84  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.33 
 
 
442 aa  82.4  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  23.45 
 
 
813 aa  82  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 
415 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 
423 aa  70.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  30 
 
 
474 aa  69.3  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  29.78 
 
 
490 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.11 
 
 
425 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  31.34 
 
 
1188 aa  65.1  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  24.01 
 
 
789 aa  64.7  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 
419 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 
425 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.68 
 
 
643 aa  63.5  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
419 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  31.25 
 
 
420 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  32.97 
 
 
430 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 
640 aa  61.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.07 
 
 
462 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
421 aa  60.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1935  hypothetical protein  21.99 
 
 
828 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.115216  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 
412 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  31.52 
 
 
795 aa  59.3  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 
592 aa  58.9  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
418 aa  58.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
418 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  34.41 
 
 
605 aa  58.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
452 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 
610 aa  58.2  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 
419 aa  58.2  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  28.64 
 
 
609 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  33.73 
 
 
1446 aa  57  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 
601 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  37.16 
 
 
592 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 
607 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.65 
 
 
615 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
418 aa  56.2  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 
808 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 
464 aa  55.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 
625 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.22 
 
 
460 aa  55.1  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  31.66 
 
 
328 aa  54.7  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 
479 aa  54.7  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 
421 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0772  hypothetical protein  36.8 
 
 
251 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.587892  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.84 
 
 
418 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  30.11 
 
 
787 aa  54.3  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2138  hypothetical protein  31.58 
 
 
337 aa  53.9  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.401823  decreased coverage  0.00313955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
561 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.22 
 
 
472 aa  54.3  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.35 
 
 
588 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.45 
 
 
505 aa  53.5  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
571 aa  53.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
467 aa  53.1  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
412 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  31.66 
 
 
328 aa  53.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 
555 aa  52.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.78 
 
 
472 aa  52.4  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.64 
 
 
344 aa  52  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
642 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  25.74 
 
 
307 aa  51.6  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
418 aa  51.6  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.64 
 
 
344 aa  51.6  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 
282 aa  51.6  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
555 aa  50.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 
686 aa  50.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  27.6 
 
 
633 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
642 aa  51.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 
627 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  24.42 
 
 
575 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
639 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 
618 aa  50.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  30.99 
 
 
452 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.42 
 
 
575 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>