218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2768 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 412 aa  826    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  86.41 
 
 		 412 aa  736    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  65.22 
 
 		 418 aa  532  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  57.79 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  45.83 
 
 		 419 aa  342  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  41.38 
 
 		 420 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  41.52 
 
 		 419 aa  315  8e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  39.85 
 
 		 421 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  34.07 
 
 		 423 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  35.58 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  32.45 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 		 455 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 		 418 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  28.79 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 421 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 426 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28.76 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.64 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  34.75 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.64 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.05 
 
 		 451 aa  106  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  27.81 
 
 		 615 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.54 
 
 		 460 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.27 
 
 		 472 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 		 467 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  27.41 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  25.9 
 
 		 464 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 446 aa  95.5  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 		 393 aa  93.6  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  27.51 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  36.05 
 
 		 459 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.42 
 
 		 505 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.84 
 
 		 819 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.91 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  26.24 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  25.81 
 
 		 610 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  31.36 
 
 		 1188 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  33.52 
 
 		 796 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  29.51 
 
 		 651 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  24.73 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 		 902 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 		 651 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.58 
 
 		 760 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  29.92 
 
 		 761 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  36.96 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.26 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.53 
 
 		 755 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.26 
 
 		 575 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.26 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.07 
 
 		 795 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 593 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  25.54 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  21.63 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.65 
 
 		 723 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  26.98 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  27.93 
 
 		 654 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.54 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.81 
 
 		 755 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  28.4 
 
 		 755 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.93 
 
 		 776 aa  63.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.52 
 
 		 1033 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  28.9 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.12 
 
 		 759 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 698 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 		 903 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.14 
 
 		 738 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 792 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.07 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.78 
 
 		 1362 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  31.13 
 
 		 1446 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.01 
 
 		 691 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.17 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.96 
 
 		 751 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  28.4 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.68 
 
 		 713 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.79 
 
 		 725 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 		 570 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  29.38 
 
 		 918 aa  59.7  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  31.73 
 
 		 775 aa  59.7  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1830  von Willebrand factor type A  35.51 
 
 		 573 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  26.21 
 
 		 709 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  39.52 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.03 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>