136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2332 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  100 
 
 
775 aa  1537    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.56 
 
 
755 aa  196  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.11 
 
 
1362 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  28.17 
 
 
761 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  22.06 
 
 
786 aa  160  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  26.18 
 
 
750 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.8 
 
 
723 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  22.97 
 
 
791 aa  157  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.07 
 
 
732 aa  157  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  24.15 
 
 
701 aa  157  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.5 
 
 
794 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.78 
 
 
712 aa  154  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.03 
 
 
759 aa  153  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.8 
 
 
751 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.03 
 
 
755 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.8 
 
 
760 aa  151  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.14 
 
 
738 aa  151  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.07 
 
 
722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  25.54 
 
 
755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.08 
 
 
725 aa  147  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  23.93 
 
 
739 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  24.8 
 
 
753 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  24.78 
 
 
819 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.65 
 
 
701 aa  141  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.02 
 
 
691 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  23.73 
 
 
713 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  25.17 
 
 
711 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.82 
 
 
763 aa  135  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  30.12 
 
 
757 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.46 
 
 
772 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.88 
 
 
772 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25 
 
 
812 aa  132  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.67 
 
 
770 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.53 
 
 
771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.93 
 
 
729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  28.53 
 
 
771 aa  129  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.48 
 
 
740 aa  128  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.96 
 
 
680 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  26.48 
 
 
789 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  24.5 
 
 
831 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.1 
 
 
671 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.98 
 
 
776 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  27.19 
 
 
796 aa  107  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
840 aa  104  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  27.11 
 
 
774 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  27.01 
 
 
833 aa  100  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 
462 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.12 
 
 
795 aa  99  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  19.71 
 
 
776 aa  87.8  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  24.5 
 
 
1120 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  28.37 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  30.73 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.82 
 
 
1033 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  31.98 
 
 
1188 aa  73.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  19.72 
 
 
959 aa  72.8  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 
419 aa  72  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  31 
 
 
480 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  32.04 
 
 
418 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28.85 
 
 
416 aa  70.1  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  33.53 
 
 
412 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.94 
 
 
418 aa  69.7  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.58 
 
 
984 aa  68.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  30.89 
 
 
421 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 
420 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.25 
 
 
451 aa  65.9  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 
363 aa  65.9  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  31.09 
 
 
419 aa  65.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.2 
 
 
442 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 
425 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
419 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 
902 aa  65.1  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  28.27 
 
 
892 aa  64.3  0.000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 
418 aa  63.9  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
418 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 
425 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.93 
 
 
963 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.22 
 
 
418 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 
415 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 
851 aa  62  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 
418 aa  62  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  30.26 
 
 
423 aa  61.6  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 
380 aa  61.6  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  31.72 
 
 
561 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  30.94 
 
 
842 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.93 
 
 
412 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.48 
 
 
717 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.39 
 
 
643 aa  60.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 
421 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  28.84 
 
 
847 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 
426 aa  58.5  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.09 
 
 
427 aa  57.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.38 
 
 
460 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
423 aa  57  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 
903 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  25.5 
 
 
479 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  31.91 
 
 
562 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  23.38 
 
 
472 aa  56.2  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>