46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1819 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  100 
 
 		 963 aa  1909    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2477  hypothetical protein  40.95 
 
 		 992 aa  641    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  35.19 
 
 		 995 aa  549  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.66 
 
 		 984 aa  489  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  26.5 
 
 		 959 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  30.49 
 
 		 1115 aa  348  3e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2860  hypothetical protein  25.83 
 
 		 1066 aa  167  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27882  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3027  signal peptide protein  42.86 
 
 		 282 aa  100  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0193368  normal  0.0163712 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02111  hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.529062  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3359  hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.783819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1425  hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000367127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2521  hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000025623  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2366  hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02152  hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.5101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1433  conserved hypothetical protein  41.03 
 
 		 258 aa  97.4  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3307  putative signal peptide protein  39.5 
 
 		 280 aa  94.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0281892 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2960  signal peptide protein  39.5 
 
 		 280 aa  94  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0142734 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5101  hypothetical protein  37.21 
 
 		 263 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58230  hypothetical protein  36.72 
 
 		 263 aa  90.9  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4998  hypothetical protein  34.88 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2571  hypothetical protein  37.29 
 
 		 270 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  3.51589e-17  normal  0.0950053 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6588  hypothetical protein  37.29 
 
 		 271 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683037  normal  0.0152413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2374  hypothetical protein  40.17 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1120 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  25.2 
 
 		 775 aa  61.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  29.33 
 
 		 713 aa  58.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3028  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0370173  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5003  hypothetical protein  27.82 
 
 		 263 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58290  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3308  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 267 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.027267 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2961  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 267 aa  56.6  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0147846 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  44.16 
 
 		 899 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5106  hypothetical protein  28.46 
 
 		 269 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.78 
 
 		 794 aa  54.7  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.29 
 
 		 791 aa  51.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  22.56 
 
 		 819 aa  49.3  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.45 
 
 		 786 aa  48.5  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.6 
 
 		 755 aa  46.6  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3152  hypothetical protein  32.29 
 
 		 446 aa  46.6  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  21.98 
 
 		 750 aa  45.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3974  hypothetical protein  28 
 
 		 922 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000192393  hitchhiker  0.00265498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  21.64 
 
 		 774 aa  45.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.03 
 
 		 753 aa  45.4  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.66 
 
 		 680 aa  44.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.19 
 
 		 831 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  21.14 
 
 		 701 aa  44.3  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>