116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1318 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  62.36 
 
 		 795 aa  671    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  100 
 
 		 796 aa  1520    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  65.38 
 
 		 774 aa  870    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  47.11 
 
 		 831 aa  606  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  57.95 
 
 		 1033 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.24 
 
 		 819 aa  295  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.28 
 
 		 794 aa  269  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  36.69 
 
 		 761 aa  266  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.79 
 
 		 812 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.29 
 
 		 1362 aa  261  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.38 
 
 		 723 aa  261  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.54 
 
 		 712 aa  260  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  32.36 
 
 		 791 aa  260  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.28 
 
 		 755 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.96 
 
 		 732 aa  257  7e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.61 
 
 		 740 aa  256  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.8 
 
 		 738 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  36.35 
 
 		 725 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  29.48 
 
 		 757 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.2 
 
 		 755 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  31.91 
 
 		 755 aa  245  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.01 
 
 		 760 aa  244  6e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  29.04 
 
 		 771 aa  242  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.03 
 
 		 751 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.08 
 
 		 771 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.59 
 
 		 772 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  32.58 
 
 		 711 aa  240  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.12 
 
 		 763 aa  238  4e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.33 
 
 		 759 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  31.03 
 
 		 750 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.68 
 
 		 772 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.27 
 
 		 701 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.38 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.67 
 
 		 786 aa  218  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.81 
 
 		 729 aa  210  9e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  25.63 
 
 		 789 aa  205  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  28.86 
 
 		 739 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.07 
 
 		 776 aa  201  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  27.89 
 
 		 776 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.17 
 
 		 753 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.17 
 
 		 770 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.29 
 
 		 722 aa  191  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.06 
 
 		 671 aa  191  5.999999999999999e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  27.4 
 
 		 701 aa  187  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  28.11 
 
 		 833 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  28.01 
 
 		 840 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.2 
 
 		 680 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 		 775 aa  114  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  25.89 
 
 		 713 aa  87.4  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.85 
 
 		 1109 aa  87  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.32 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 412 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  32.46 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.77 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 		 419 aa  72  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  32.12 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  32.81 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  30 
 
 		 1188 aa  67.8  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.24 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  26.72 
 
 		 902 aa  65.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.95 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 		 393 aa  62  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.09 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  29.27 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 903 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 		 412 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 		 423 aa  56.6  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2026  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 599 aa  55.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 1446 aa  55.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 851 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  31.85 
 
 		 570 aa  54.3  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  30.97 
 
 		 828 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16980  uncharacterized conserved protein (DUF2135)  29.57 
 
 		 1115 aa  53.9  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  29.17 
 
 		 523 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 411 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 		 427 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.02 
 
 		 460 aa  52.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.98 
 
 		 847 aa  52.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 416 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 		 472 aa  51.2  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  24.06 
 
 		 959 aa  51.2  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  28.03 
 
 		 582 aa  51.2  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.85 
 
 		 984 aa  50.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 418 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 418 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  30.3 
 
 		 421 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.51 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 888 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.51 
 
 		 459 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  32.08 
 
 		 914 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>