50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1806 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 338 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  35.81 
 
 		 833 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  38.24 
 
 		 840 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.91 
 
 		 712 aa  102  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  24.75 
 
 		 819 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.04 
 
 		 691 aa  95.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.41 
 
 		 812 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.44 
 
 		 701 aa  94  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  27.55 
 
 		 789 aa  87.4  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  29.85 
 
 		 711 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  31.78 
 
 		 701 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.27 
 
 		 776 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.17 
 
 		 796 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.34 
 
 		 794 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.31 
 
 		 759 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.46 
 
 		 763 aa  79.3  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  26.37 
 
 		 774 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.09 
 
 		 1362 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  25.99 
 
 		 750 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.87 
 
 		 760 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.8 
 
 		 791 aa  76.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.39 
 
 		 751 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.11 
 
 		 671 aa  75.5  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.11 
 
 		 1033 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.39 
 
 		 755 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  28.68 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.52 
 
 		 722 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  23.01 
 
 		 776 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  22.88 
 
 		 761 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.91 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.68 
 
 		 795 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  27.91 
 
 		 772 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.46 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  27.13 
 
 		 771 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.91 
 
 		 772 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.35 
 
 		 753 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.36 
 
 		 755 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  23.72 
 
 		 831 aa  65.9  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  21.09 
 
 		 723 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  24.81 
 
 		 755 aa  62.8  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  21.48 
 
 		 786 aa  62  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.74 
 
 		 770 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.82 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  19.68 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.96 
 
 		 732 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  22.51 
 
 		 738 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.53 
 
 		 725 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  23.63 
 
 		 1109 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 		 775 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5961  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 802 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>