170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3690 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  100 
 
 		 680 aa  1391    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  39.85 
 
 		 713 aa  482  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.59 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.47 
 
 		 691 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.56 
 
 		 812 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  24.74 
 
 		 711 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.66 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.28 
 
 		 671 aa  146  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.09 
 
 		 794 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.71 
 
 		 791 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  25.16 
 
 		 755 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  26.27 
 
 		 761 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  22.48 
 
 		 819 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.79 
 
 		 1362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.5 
 
 		 712 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  22.17 
 
 		 763 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.08 
 
 		 755 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  26.06 
 
 		 774 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.79 
 
 		 755 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  23.39 
 
 		 750 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.49 
 
 		 775 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  22.06 
 
 		 776 aa  117  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  21.57 
 
 		 739 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.13 
 
 		 751 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.84 
 
 		 776 aa  109  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  25.38 
 
 		 831 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.06 
 
 		 760 aa  107  9e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.45 
 
 		 732 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  23.87 
 
 		 796 aa  105  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  22.33 
 
 		 701 aa  104  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.92 
 
 		 723 aa  103  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.07 
 
 		 722 aa  102  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  25.12 
 
 		 738 aa  102  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  20.98 
 
 		 757 aa  101  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.63 
 
 		 1033 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24.45 
 
 		 725 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.17 
 
 		 740 aa  92  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  22.1 
 
 		 753 aa  91.3  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  21.84 
 
 		 833 aa  89.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.09 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  20.06 
 
 		 786 aa  84  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  23.46 
 
 		 772 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  23.46 
 
 		 771 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.43 
 
 		 771 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  20.81 
 
 		 789 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  23.15 
 
 		 772 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  21.01 
 
 		 770 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.08 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  22.01 
 
 		 840 aa  77.8  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.51 
 
 		 729 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 		 546 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  32.7 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  32.08 
 
 		 633 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 		 642 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  31.87 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  20.11 
 
 		 984 aa  65.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  33.12 
 
 		 642 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  32.7 
 
 		 625 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.7 
 
 		 380 aa  64.7  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.82 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  29.12 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  32.08 
 
 		 624 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  31.87 
 
 		 642 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.51 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.68 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0051  von Willebrand factor type A  27.6 
 
 		 325 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 		 610 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  28.14 
 
 		 317 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.19 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  28.31 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.67 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  23.73 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  27.62 
 
 		 686 aa  58.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.82 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.48 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  27.22 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  22.34 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  25.26 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.67 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 654 aa  57.4  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  31.54 
 
 		 792 aa  57  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.51 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.75 
 
 		 629 aa  56.2  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.54 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  32.3 
 
 		 559 aa  54.3  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  22.49 
 
 		 411 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 		 393 aa  53.9  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 566 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2507  hypothetical protein  22.78 
 
 		 834 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.669353  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 339 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>