94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0122 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  100 
 
 		 763 aa  1573    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.72 
 
 		 712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  37.22 
 
 		 750 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.66 
 
 		 755 aa  433  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  37.71 
 
 		 757 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  36.73 
 
 		 789 aa  431  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  37.42 
 
 		 791 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.64 
 
 		 772 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.9 
 
 		 759 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  36.66 
 
 		 760 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.34 
 
 		 772 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.6 
 
 		 771 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.65 
 
 		 770 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.69 
 
 		 755 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  37.41 
 
 		 771 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.23 
 
 		 794 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.81 
 
 		 740 aa  405  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  35.14 
 
 		 739 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  35.78 
 
 		 755 aa  399  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  36.73 
 
 		 701 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.14 
 
 		 786 aa  399  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.89 
 
 		 738 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.98 
 
 		 732 aa  392  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  34.8 
 
 		 761 aa  388  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.49 
 
 		 723 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.3 
 
 		 729 aa  353  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.05 
 
 		 725 aa  352  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.74 
 
 		 753 aa  333  6e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.2 
 
 		 1362 aa  303  9e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  38.25 
 
 		 751 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  30.2 
 
 		 819 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.04 
 
 		 722 aa  273  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.65 
 
 		 776 aa  251  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  29.4 
 
 		 711 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.98 
 
 		 691 aa  237  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.27 
 
 		 795 aa  228  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  28.38 
 
 		 774 aa  222  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.97 
 
 		 796 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.1 
 
 		 1033 aa  213  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  26.7 
 
 		 831 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  25.76 
 
 		 776 aa  204  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.96 
 
 		 701 aa  166  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.59 
 
 		 812 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.27 
 
 		 671 aa  148  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 		 775 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  22.17 
 
 		 680 aa  126  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  25.47 
 
 		 713 aa  101  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 		 833 aa  100  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 		 840 aa  94.7  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.46 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  33.57 
 
 		 1109 aa  78.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  27.42 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  22.8 
 
 		 462 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  24.3 
 
 		 393 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.97 
 
 		 903 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  21.4 
 
 		 418 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 		 421 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.01 
 
 		 575 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  23.01 
 
 		 575 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  22.48 
 
 		 419 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  27.66 
 
 		 918 aa  53.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.58 
 
 		 523 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.12 
 
 		 588 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  24.29 
 
 		 562 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  20.87 
 
 		 420 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 547 aa  51.2  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  24 
 
 		 847 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  23.26 
 
 		 571 aa  51.2  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 		 828 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  22.64 
 
 		 419 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 		 543 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 717 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  19.05 
 
 		 415 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  26 
 
 		 851 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 534 aa  48.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0881  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 		 1077 aa  48.1  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  30.97 
 
 		 942 aa  47.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  21.83 
 
 		 412 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  24.83 
 
 		 959 aa  47  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3062  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  22.01 
 
 		 984 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  21.72 
 
 		 418 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  23.44 
 
 		 562 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  22.29 
 
 		 412 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.51 
 
 		 5962 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  20.29 
 
 		 363 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  23.13 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  21.69 
 
 		 480 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  22.87 
 
 		 418 aa  45.1  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  25.23 
 
 		 698 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 744 aa  45.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  25 
 
 		 995 aa  45.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 		 412 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  23.73 
 
 		 412 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 411 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>