209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2394 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  86.41 
 
 		 412 aa  718    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 412 aa  829    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  65.22 
 
 		 418 aa  526  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  58.03 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  43.63 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  42.3 
 
 		 421 aa  316  6e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  41.63 
 
 		 420 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  41.52 
 
 		 419 aa  312  9e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  34.56 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  34.86 
 
 		 418 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  33.25 
 
 		 425 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  31.8 
 
 		 425 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4213  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 418 aa  158  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.92 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.52 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  29.07 
 
 		 427 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  28.75 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.21 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.07 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  31.56 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.4 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  36.36 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  29.37 
 
 		 615 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.81 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.01 
 
 		 451 aa  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 472 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  32.82 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.75 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  25.69 
 
 		 441 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  26.24 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 459 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 430 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  24.89 
 
 		 464 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.53 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 		 467 aa  86.7  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  26.55 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 		 819 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.67 
 
 		 1188 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  29.78 
 
 		 490 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 480 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 592 aa  73.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.96 
 
 		 755 aa  73.2  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  30.19 
 
 		 761 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.67 
 
 		 1033 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 		 903 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  23.83 
 
 		 902 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  26.02 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  32.46 
 
 		 796 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.54 
 
 		 729 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  34.3 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.46 
 
 		 795 aa  67  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  21.16 
 
 		 383 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  26.37 
 
 		 593 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  29.78 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  26.98 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.65 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.22 
 
 		 1362 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 1446 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.76 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  24.89 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  28.69 
 
 		 143 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  28.05 
 
 		 755 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.41 
 
 		 691 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  23.08 
 
 		 625 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.14 
 
 		 738 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.94 
 
 		 776 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.89 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 888 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.11 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  27.32 
 
 		 651 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.19 
 
 		 701 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.82 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 642 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.21 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  24.71 
 
 		 523 aa  58.9  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 642 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  35.48 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  28.18 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 792 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  21.54 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.26 
 
 		 751 aa  57.8  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  26.67 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>