132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2659 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  61.99 
 
 		 575 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  61.99 
 
 		 575 aa  720    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  60.98 
 
 		 588 aa  736    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  95.82 
 
 		 598 aa  1121    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 593 aa  1218    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  49.42 
 
 		 566 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  48.09 
 
 		 571 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  48.42 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  44.28 
 
 		 642 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  44.57 
 
 		 642 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  47.69 
 
 		 640 aa  435  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  44.28 
 
 		 627 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  42.37 
 
 		 642 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  41.1 
 
 		 613 aa  427  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  40.44 
 
 		 633 aa  425  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  46.97 
 
 		 613 aa  422  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  43.43 
 
 		 639 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  40.76 
 
 		 624 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  40.92 
 
 		 625 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  45.85 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  39.97 
 
 		 612 aa  415  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  45.55 
 
 		 706 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  42.94 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  46.75 
 
 		 651 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  40.75 
 
 		 698 aa  412  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  40.99 
 
 		 621 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  46.12 
 
 		 651 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  45.7 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  44.68 
 
 		 709 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  44.56 
 
 		 686 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  43.61 
 
 		 708 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  44.78 
 
 		 792 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  43.24 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  43.72 
 
 		 654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  40.99 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  49.12 
 
 		 350 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  38.59 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  38.39 
 
 		 555 aa  283  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  34.46 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  32.21 
 
 		 610 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  33.73 
 
 		 490 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  34.5 
 
 		 500 aa  207  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  28.73 
 
 		 859 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  33.6 
 
 		 462 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  32.57 
 
 		 935 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  31.36 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.57 
 
 		 460 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 		 472 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.13 
 
 		 472 aa  97.4  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  31.28 
 
 		 412 aa  93.6  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  30.61 
 
 		 479 aa  93.2  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.43 
 
 		 442 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  28.82 
 
 		 430 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 423 aa  90.5  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 		 419 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.98 
 
 		 451 aa  87.8  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  31.31 
 
 		 459 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  30.73 
 
 		 615 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  31.05 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 		 808 aa  80.5  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  32.54 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.04 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.4 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  32.54 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  31.61 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.89 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  31.71 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  26.64 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 412 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  22.5 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  24.72 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  30.18 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.06 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 		 1100 aa  56.2  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  29.07 
 
 		 1188 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 		 819 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  31.47 
 
 		 744 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2086  putative outer membrane protein  36.78 
 
 		 92 aa  53.9  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100927  normal  0.359914 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 423 aa  53.9  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  22.57 
 
 		 816 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  33.55 
 
 		 477 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  26.09 
 
 		 739 aa  51.6  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01615  hypothetical protein  42.62 
 
 		 86 aa  51.6  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  24.24 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  32.41 
 
 		 795 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  26.76 
 
 		 966 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>