181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0197 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  100 
 
 
795 aa  1619    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  37.78 
 
 
1188 aa  96.3  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  36.81 
 
 
3027 aa  88.6  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.16 
 
 
643 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1491  hypothetical protein  32.45 
 
 
1258 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.813394  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 
892 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  36.02 
 
 
1100 aa  73.9  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  29.92 
 
 
317 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0254  hypothetical protein  30.1 
 
 
313 aa  70.5  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.155283 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  33.5 
 
 
1446 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1754  von Willebrand factor, type A  30.89 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.294878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  29.39 
 
 
902 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  30.04 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  30.39 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1806  hypothetical protein  30.26 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.539334  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  30.69 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  34.16 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 
308 aa  67  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 
307 aa  67  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4902  von Willebrand factor type A  28.84 
 
 
319 aa  67  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745453  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.56 
 
 
327 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.2 
 
 
344 aa  65.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 
459 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0006  von Willebrand factor, type A  32.07 
 
 
592 aa  64.7  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  28.72 
 
 
579 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3055  von Willebrand factor type A  30.92 
 
 
324 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  29.18 
 
 
842 aa  63.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  28.7 
 
 
334 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27 
 
 
479 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.51 
 
 
412 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1710  von Willebrand factor type A  32.47 
 
 
698 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.425591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0522  von Willebrand factor type A  28.5 
 
 
346 aa  62  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 
316 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  29.56 
 
 
333 aa  60.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28 
 
 
329 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.86 
 
 
332 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0603  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 
316 aa  58.5  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.623778  normal  0.0597521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.37 
 
 
351 aa  58.9  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  28.57 
 
 
349 aa  58.5  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
421 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02345  von Willebrand factor type A domain protein  29.72 
 
 
335 aa  58.9  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  29.55 
 
 
717 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  32.12 
 
 
966 aa  57.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  31.19 
 
 
609 aa  57.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1128  von Willebrand factor, type A  30.24 
 
 
282 aa  57.8  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0959166  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3232  von Willebrand factor type A  29.21 
 
 
334 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.34963  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 
744 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  30.32 
 
 
329 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 
430 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.01 
 
 
412 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2292  von Willebrand factor type A  30.85 
 
 
325 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  28 
 
 
336 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 
774 aa  56.2  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  27.41 
 
 
328 aa  55.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
418 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.57 
 
 
341 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  27.23 
 
 
343 aa  55.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0123  von Willebrand factor type A  30.61 
 
 
491 aa  56.2  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0626455  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  34.92 
 
 
982 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 
334 aa  55.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  34.19 
 
 
777 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
418 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  27.5 
 
 
334 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
358 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  28.42 
 
 
334 aa  54.7  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 
328 aa  54.7  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  25.98 
 
 
330 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  26.96 
 
 
336 aa  54.7  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1317  von Willebrand factor type A  30.86 
 
 
298 aa  54.3  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0738378  normal  0.207209 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1641  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 
316 aa  54.3  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
380 aa  53.5  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.18 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0656  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 
309 aa  53.9  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2815  von Willebrand factor, type A  26.5 
 
 
327 aa  53.9  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  26.87 
 
 
342 aa  54.3  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.92 
 
 
358 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  32.26 
 
 
328 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  23.9 
 
 
442 aa  53.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 
888 aa  53.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  21.4 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  26.91 
 
 
334 aa  53.1  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
331 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4011  von Willebrand factor, type A  31.72 
 
 
328 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.204351  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  28.5 
 
 
320 aa  53.1  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  28.92 
 
 
358 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  27.23 
 
 
335 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  31.52 
 
 
972 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  27.4 
 
 
358 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  26.85 
 
 
352 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  29.27 
 
 
313 aa  52.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  33.1 
 
 
598 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
339 aa  52.4  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 
339 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2067  hypothetical protein  27.86 
 
 
337 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  27.83 
 
 
345 aa  52  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  30.22 
 
 
418 aa  52  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 
349 aa  52  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  26 
 
 
788 aa  51.6  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  28.8 
 
 
744 aa  51.6  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  30.5 
 
 
316 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>