82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3008 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3008  peptidase M23B  100 
 
 		 982 aa  1976    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.631007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3011  von Willebrand factor, type A  56.42 
 
 		 774 aa  821    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0179929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2675  von Willebrand factor type A  58.3 
 
 		 777 aa  848    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0948  hypothetical protein  29.55 
 
 		 560 aa  74.3  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.265105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  45.12 
 
 		 3027 aa  68.2  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.45 
 
 		 1188 aa  67.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  35 
 
 		 1045 aa  65.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1143  PKD domain containing protein  35 
 
 		 1309 aa  65.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  28.5 
 
 		 874 aa  64.7  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2142  M6 family metalloprotease domain-containing protein  31.16 
 
 		 927 aa  64.7  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  31 
 
 		 868 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  25.06 
 
 		 971 aa  63.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1059  von Willebrand factor type A  32.21 
 
 		 625 aa  62.4  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0405627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  28.82 
 
 		 1154 aa  62.4  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  38.39 
 
 		 562 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  36.67 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3339  hypothetical protein  32.22 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2642  M6 family metalloprotease domain protein  34.95 
 
 		 751 aa  58.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1492  von Willebrand factor, type A  30.7 
 
 		 892 aa  58.2  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  33.81 
 
 		 851 aa  57.8  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  30.25 
 
 		 787 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2216  von Willebrand factor type A  37.9 
 
 		 427 aa  56.6  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.359753  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  34.06 
 
 		 795 aa  57  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6351  hypothetical protein  28.7 
 
 		 924 aa  57  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  25.87 
 
 		 715 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2073  von Willebrand factor, type A  35.33 
 
 		 436 aa  56.2  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.04125  normal  0.439198 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2257  M6 family metalloprotease domain protein  32.81 
 
 		 811 aa  55.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0627  beta-lactamase  35.19 
 
 		 566 aa  55.1  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1491  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1258 aa  54.7  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.813394  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 418 aa  54.3  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  20.86 
 
 		 1215 aa  52.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 		 1336 aa  52.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3178  hypothetical protein  27.43 
 
 		 405 aa  53.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  31.93 
 
 		 1100 aa  52.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  33.09 
 
 		 847 aa  52.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  30.36 
 
 		 430 aa  52  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1564  M6 family metalloprotease domain protein  27.41 
 
 		 770 aa  52  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  35.83 
 
 		 334 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  38.89 
 
 		 828 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  31.3 
 
 		 317 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.73 
 
 		 479 aa  51.2  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  27.55 
 
 		 1017 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  32.59 
 
 		 1053 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1306  von Willebrand factor type A  34.35 
 
 		 681 aa  51.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104381  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0345  proprotein convertase P  28.38 
 
 		 693 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28 
 
 		 416 aa  51.2  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0648  von Willebrand factor, type A  30.09 
 
 		 307 aa  51.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.84 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536074  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.28 
 
 		 344 aa  49.7  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.28 
 
 		 344 aa  50.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  36.63 
 
 		 842 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3437  hypothetical protein  30.09 
 
 		 666 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.54517  normal  0.0867765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0927  hypothetical protein  35.56 
 
 		 633 aa  49.7  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0799  M6 family metalloprotease domain-containing protein  34.09 
 
 		 744 aa  49.7  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.252815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  20.86 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1277  peptidase M6, immune inhibitor A  27.69 
 
 		 781 aa  48.9  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.733002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  37.88 
 
 		 462 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  31.39 
 
 		 788 aa  48.5  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.93 
 
 		 1033 aa  48.1  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 		 888 aa  48.1  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  30.82 
 
 		 643 aa  48.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  37.08 
 
 		 412 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.79 
 
 		 651 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  23.33 
 
 		 1215 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  23.33 
 
 		 1215 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1607  hypothetical protein  27.1 
 
 		 666 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  34.48 
 
 		 324 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 		 411 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 328 aa  45.8  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  35 
 
 		 320 aa  45.8  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  30.08 
 
 		 336 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 		 342 aa  45.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1773  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 316 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.320362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 480 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4803  M6 family metalloprotease domain-containing protein  33.78 
 
 		 747 aa  45.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.92 
 
 		 1215 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0616  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 		 308 aa  45.1  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.544287  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  25.69 
 
 		 918 aa  44.7  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.15 
 
 		 575 aa  44.7  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 		 575 aa  44.7  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2495  von Willebrand factor type A  27.27 
 
 		 316 aa  44.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  32.63 
 
 		 467 aa  44.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>