198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6113 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  100 
 
 
430 aa  849    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 
462 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32.48 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.22 
 
 
479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 
411 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.34 
 
 
416 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 
412 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  36 
 
 
459 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.07 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  27.53 
 
 
472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.4 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.22 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.21 
 
 
615 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  32.77 
 
 
418 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  29.43 
 
 
610 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.39 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  29.17 
 
 
598 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  33.99 
 
 
505 aa  95.5  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.06 
 
 
523 aa  94  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 
593 aa  93.2  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.6 
 
 
419 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  29.9 
 
 
425 aa  89.7  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25.87 
 
 
419 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 
575 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.12 
 
 
588 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  27.84 
 
 
602 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.12 
 
 
575 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.81 
 
 
563 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  23.36 
 
 
421 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.3 
 
 
420 aa  87  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  31.38 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  29.35 
 
 
566 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.38 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  31.94 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 
592 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  24.66 
 
 
418 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  24.66 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  27.15 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  35.45 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.84 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  26.99 
 
 
633 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 
571 aa  80.9  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 
654 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
642 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
642 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
627 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
612 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 
642 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  29.86 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
808 aa  77.4  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  33.06 
 
 
555 aa  77.4  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  26.8 
 
 
640 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  33.71 
 
 
903 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 
625 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
639 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  24.55 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  30.94 
 
 
427 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 
613 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  26.04 
 
 
624 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.91 
 
 
629 aa  73.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  29.62 
 
 
555 aa  73.9  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 
625 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 
464 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  29.64 
 
 
708 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  25.14 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.73 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  27.98 
 
 
792 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 
651 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.09 
 
 
621 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 
441 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  25.09 
 
 
536 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.63 
 
 
761 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
551 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.02 
 
 
776 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.47 
 
 
651 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3147  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 
420 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.03337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  32.58 
 
 
744 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  31.32 
 
 
842 aa  66.6  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  26.39 
 
 
698 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  28.98 
 
 
717 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  27.92 
 
 
755 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  26.86 
 
 
709 aa  64.7  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.81 
 
 
759 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.81 
 
 
751 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  24.59 
 
 
363 aa  63.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  26.46 
 
 
613 aa  63.5  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.81 
 
 
755 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.34 
 
 
725 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0197  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 
795 aa  63.2  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.48931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  31.32 
 
 
966 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  25.45 
 
 
592 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>