141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4090 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1206    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  33.73 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  31.3 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.61 
 
 		 416 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.92 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 610 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  29.46 
 
 		 412 aa  90.9  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  32.24 
 
 		 490 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.48 
 
 		 451 aa  88.2  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  32.55 
 
 		 500 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6385  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 523 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  25.27 
 
 		 592 aa  85.5  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.45 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  24.93 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  29.33 
 
 		 505 aa  81.3  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  28.38 
 
 		 536 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 654 aa  80.5  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.71 
 
 		 460 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  28.69 
 
 		 615 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 642 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.71 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.2 
 
 		 592 aa  77.8  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.99 
 
 		 575 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.55 
 
 		 588 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  29.29 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.31 
 
 		 621 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  26.98 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  25.65 
 
 		 459 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 		 613 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 		 418 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  27.35 
 
 		 555 aa  71.6  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  24.1 
 
 		 686 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  23.42 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  25.55 
 
 		 706 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 		 625 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  25.11 
 
 		 633 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  26.43 
 
 		 698 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 		 640 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  25.74 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  25.74 
 
 		 593 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  26.43 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 625 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.08 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  21.4 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  25 
 
 		 651 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 859 aa  67.4  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  23.98 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  24.23 
 
 		 792 aa  67.4  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 452 aa  67  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  24.1 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  20.56 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  24.17 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  26.1 
 
 		 452 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  26.3 
 
 		 555 aa  62.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  24.37 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  23.36 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  30.33 
 
 		 808 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  22.51 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  27.2 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  23.25 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  25.11 
 
 		 1188 aa  58.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  22.66 
 
 		 639 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.57 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  22.91 
 
 		 588 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  31.78 
 
 		 847 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 393 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  23.21 
 
 		 363 aa  55.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  26.54 
 
 		 420 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  22.86 
 
 		 425 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1135  von Willebrand factor type A  24.56 
 
 		 446 aa  55.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0216745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  21.6 
 
 		 423 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  22.62 
 
 		 561 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  23.5 
 
 		 760 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  22.53 
 
 		 426 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  23.31 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  23.35 
 
 		 418 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.97 
 
 		 738 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  31.2 
 
 		 903 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  24.89 
 
 		 795 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  23.94 
 
 		 415 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 		 423 aa  51.6  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  29.73 
 
 		 851 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  22.94 
 
 		 418 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  29.32 
 
 		 951 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 		 744 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  22.46 
 
 		 474 aa  50.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  23.02 
 
 		 523 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2062  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.78 
 
 		 673 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.71 
 
 		 412 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.83 
 
 		 1362 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  22.33 
 
 		 842 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>