212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7173 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  100 
 
 
462 aa  948    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  35.75 
 
 
416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.99 
 
 
442 aa  211  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.82 
 
 
460 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  33.82 
 
 
472 aa  196  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  33.58 
 
 
472 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.68 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.14 
 
 
451 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  42.74 
 
 
412 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.89 
 
 
479 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.29 
 
 
430 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  30.63 
 
 
615 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  34.38 
 
 
480 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 
419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 
412 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  37.2 
 
 
425 aa  124  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  36.71 
 
 
425 aa  123  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  33.6 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  33.6 
 
 
598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  30.57 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  30 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.29 
 
 
412 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  35.08 
 
 
575 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  30.41 
 
 
459 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.08 
 
 
575 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  34.01 
 
 
610 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 
426 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.08 
 
 
588 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  29.22 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  26.65 
 
 
523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  32.34 
 
 
490 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  37.04 
 
 
415 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  31.11 
 
 
505 aa  110  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
421 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 
418 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  30.89 
 
 
602 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  30.04 
 
 
418 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  34.62 
 
 
566 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 
419 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
418 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  29.76 
 
 
418 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  33.81 
 
 
500 aa  106  9e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  35.44 
 
 
633 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  31.07 
 
 
420 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  31.55 
 
 
419 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.89 
 
 
412 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.74 
 
 
418 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  34.93 
 
 
639 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  31.47 
 
 
571 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 
627 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 
642 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  33.5 
 
 
642 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  32.69 
 
 
563 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  34.78 
 
 
592 aa  99  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  33.5 
 
 
642 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  30.3 
 
 
350 aa  97.1  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  29.02 
 
 
427 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  32.89 
 
 
640 aa  97.1  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  33.98 
 
 
625 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  33.5 
 
 
625 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  33.01 
 
 
613 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  28.35 
 
 
393 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  33.01 
 
 
624 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  33.85 
 
 
612 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  34.24 
 
 
706 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
792 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  31.41 
 
 
651 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  26.48 
 
 
775 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  34.24 
 
 
698 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
551 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  29.86 
 
 
686 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  35.33 
 
 
621 aa  87.4  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  30.89 
 
 
651 aa  87.4  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 
536 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  29.08 
 
 
555 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
709 aa  80.5  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  27.62 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  33.68 
 
 
555 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
903 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  32.45 
 
 
1188 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  27.67 
 
 
629 aa  79  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
588 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  30.66 
 
 
708 aa  78.2  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
808 aa  78.2  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 
859 aa  77.4  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  30.25 
 
 
452 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  26.6 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.77 
 
 
654 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5589  hypothetical protein  43.33 
 
 
143 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.17 
 
 
770 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  31.31 
 
 
951 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  27.67 
 
 
613 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  26.37 
 
 
760 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2762  von Willebrand factor type A  25.93 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23614  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  34.44 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  28.33 
 
 
842 aa  65.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1492  von Willebrand factor, type A  29.7 
 
 
383 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>