166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3260 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  100 
 
 
903 aa  1820    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  33.62 
 
 
951 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  31.11 
 
 
966 aa  351  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  32.6 
 
 
972 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  30.31 
 
 
918 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  29.62 
 
 
958 aa  313  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  30.34 
 
 
914 aa  311  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3926  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 
978 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1891  von Willebrand factor, type A  29.3 
 
 
932 aa  283  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  28.19 
 
 
950 aa  281  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  29.11 
 
 
828 aa  274  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3821  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
936 aa  273  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.608594  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 
851 aa  267  5.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  25.51 
 
 
902 aa  267  8e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
888 aa  262  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  31.31 
 
 
842 aa  259  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  30.48 
 
 
847 aa  250  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4003  protein of unknown function DUF1355  25.46 
 
 
1023 aa  208  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0902905  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1164  von Willebrand factor type A  25.46 
 
 
859 aa  170  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.366027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 
744 aa  110  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 
717 aa  99.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1368  von Willebrand factor type A  24.76 
 
 
788 aa  89.7  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.483102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  36.52 
 
 
442 aa  88.6  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  31.4 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 
416 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  30.27 
 
 
462 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  30.39 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  33.99 
 
 
412 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 
459 aa  75.1  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  31.79 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  33.15 
 
 
430 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  31.54 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  32.68 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.69 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.8 
 
 
460 aa  68.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.1 
 
 
418 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  34.31 
 
 
393 aa  67.4  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.8 
 
 
472 aa  67  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 
472 aa  67.4  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 
418 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 
418 aa  67  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 
415 aa  65.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  30.11 
 
 
419 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  25.85 
 
 
467 aa  65.1  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  28.42 
 
 
1188 aa  64.7  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  30.07 
 
 
419 aa  64.3  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.14 
 
 
610 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  31.33 
 
 
427 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.37 
 
 
420 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01450  hypothetical protein  30.15 
 
 
744 aa  63.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.657991  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.23 
 
 
423 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.19 
 
 
418 aa  62.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  28.42 
 
 
363 aa  62.4  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25.97 
 
 
571 aa  62.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0123  von Willebrand factor type A  27.37 
 
 
491 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0626455  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0771  von Willebrand factor, type A  24.48 
 
 
789 aa  61.6  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.65454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.48 
 
 
425 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.17 
 
 
412 aa  61.6  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
412 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  31.82 
 
 
490 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  27.56 
 
 
426 aa  59.7  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  23.83 
 
 
464 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  31.21 
 
 
750 aa  59.3  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  25.99 
 
 
698 aa  58.9  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  35.51 
 
 
794 aa  58.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  23.18 
 
 
441 aa  58.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3332  von Willebrand factor, type A  29.41 
 
 
477 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0350677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  30.38 
 
 
755 aa  57.4  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2646  hypothetical protein  21.72 
 
 
877 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0657655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.48 
 
 
763 aa  56.6  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  27.59 
 
 
671 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 
425 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0838  protein of unknown function DUF1355  24.05 
 
 
796 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 
505 aa  56.6  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.01 
 
 
615 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  34.06 
 
 
791 aa  55.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0801  hypothetical protein  23.37 
 
 
813 aa  55.1  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.57 
 
 
755 aa  55.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0048  von Willebrand factor type A  30 
 
 
474 aa  55.5  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2065  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
380 aa  54.3  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.06 
 
 
759 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.77 
 
 
755 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  32.92 
 
 
774 aa  54.3  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.54 
 
 
701 aa  54.3  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  23.43 
 
 
640 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  30.94 
 
 
1100 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
808 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
686 aa  53.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2506  von Willebrand factor, type A  27.59 
 
 
362 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  26.04 
 
 
592 aa  53.5  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  36.36 
 
 
1033 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.64 
 
 
479 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2163  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
440 aa  52.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.820546  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  28.88 
 
 
562 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.99 
 
 
831 aa  52.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4557  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 
425 aa  52.4  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.659076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.77 
 
 
751 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>