110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6336 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  100 
 
 
808 aa  1622    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3077  hypothetical protein  30.31 
 
 
816 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  32.76 
 
 
490 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  29.13 
 
 
629 aa  98.6  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2141  von Willebrand factor type A  27.45 
 
 
610 aa  97.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  32.49 
 
 
412 aa  96.3  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  28 
 
 
416 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  28.76 
 
 
698 aa  94.4  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 
592 aa  94  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  27.72 
 
 
563 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1049  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 
555 aa  89.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.691019  normal  0.362005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0254  von Willebrand factor, type A  31.1 
 
 
615 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406076  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  28.1 
 
 
706 aa  87.8  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  29.84 
 
 
566 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  25.98 
 
 
571 aa  86.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1063  von Willebrand factor type A  29.1 
 
 
555 aa  85.9  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000708626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0325  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 
859 aa  84.7  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5984  von Willebrand factor type A  28.62 
 
 
654 aa  84.3  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.045393  normal  0.108716 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  27.13 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0841  von Willebrand factor, type A  26.64 
 
 
686 aa  84  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.306061 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3153  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 
613 aa  84  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.573485  normal  0.703806 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  28.02 
 
 
411 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1387  von Willebrand factor type A  24.84 
 
 
575 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.336718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3055  von Willebrand factor, type A  26.06 
 
 
625 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.548122 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2419  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.84 
 
 
575 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.433183  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1139  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3252  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246065 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2451  von Willebrand factor type A domain protein  25.24 
 
 
598 aa  81.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3075  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
536 aa  80.9  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2426  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.84 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0824  arginine biosynthesis bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase  26.4 
 
 
708 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2659  von Willebrand factor, type A  25.24 
 
 
593 aa  80.5  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.101316  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2973  von Willebrand factor, type A  26.33 
 
 
624 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00160061  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1306  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.7 
 
 
460 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.478577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0155  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 
500 aa  80.1  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0565906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1043  von Willebrand factor, type A  25.99 
 
 
633 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.359154  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1416  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 
472 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0158  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 
625 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1105  von Willebrand factor type A  26.64 
 
 
642 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  26.05 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.64 
 
 
442 aa  77.8  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1038  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 
642 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2761  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.67 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00899229  hitchhiker  0.00197042 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  25.33 
 
 
651 aa  77.4  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
651 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3319  von Willebrand factor type A  23.18 
 
 
640 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.041713  hitchhiker  0.00219291 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3552  von Willebrand factor type A domain-containing protein  24.43 
 
 
621 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1077  von Willebrand factor, type A  23.45 
 
 
612 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0195033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  26.67 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1986  von Willebrand factor type A  25.71 
 
 
792 aa  75.1  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
430 aa  73.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1248  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 
592 aa  72.4  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5035  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 
709 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.668602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0263  von Willebrand factor type A  21.67 
 
 
551 aa  67.8  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.62 
 
 
451 aa  67  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  26.27 
 
 
459 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  28.01 
 
 
639 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2868  von Willebrand factor type A  30 
 
 
467 aa  65.1  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6907  von Willebrand factor type A  26.82 
 
 
588 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  28.51 
 
 
966 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3334  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
441 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0867289  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 
425 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 
480 aa  60.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  27.73 
 
 
393 aa  58.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
505 aa  58.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3755  von Willebrand factor type A  29.7 
 
 
958 aa  57.4  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00649102  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4090  hypothetical protein  28.44 
 
 
602 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0826588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1222  von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 
888 aa  55.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
425 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.41 
 
 
420 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.09 
 
 
418 aa  55.5  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  25.4 
 
 
613 aa  55.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 
419 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 
412 aa  55.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 
419 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0004  von Willebrand factor, type A  29.5 
 
 
464 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  29.61 
 
 
914 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  26.52 
 
 
903 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  26.2 
 
 
412 aa  53.5  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  26.42 
 
 
972 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0249  von Willebrand factor type A  23.7 
 
 
950 aa  53.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  25.48 
 
 
701 aa  52.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  23.66 
 
 
418 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  24.6 
 
 
412 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  28.79 
 
 
918 aa  51.6  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  25.24 
 
 
419 aa  51.2  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.78 
 
 
794 aa  51.2  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  27.38 
 
 
412 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.94 
 
 
755 aa  50.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  25.53 
 
 
418 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.06 
 
 
655 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.13 
 
 
423 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2520  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
452 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.579263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.67 
 
 
415 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  24.39 
 
 
423 aa  48.5  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  26.24 
 
 
791 aa  48.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 
607 aa  48.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 
527 aa  46.2  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  26.83 
 
 
618 aa  47  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>