49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3360 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 527 aa  1040    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  37.52 
 
 		 594 aa  248  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  37.58 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  29.69 
 
 		 564 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 		 515 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 587 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  34.82 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  32.29 
 
 		 814 aa  128  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 		 599 aa  127  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  31.95 
 
 		 583 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  26.65 
 
 		 586 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  26.23 
 
 		 596 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  34.23 
 
 		 609 aa  109  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  28.92 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  30.51 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  32.18 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 		 607 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 		 593 aa  97.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  31.68 
 
 		 583 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  36.89 
 
 		 655 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  33.19 
 
 		 605 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 		 601 aa  93.6  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  24.18 
 
 		 560 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  25.93 
 
 		 584 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  29.91 
 
 		 615 aa  87  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  34.2 
 
 		 594 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  29.9 
 
 		 583 aa  72.8  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  27.43 
 
 		 618 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  26.6 
 
 		 685 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  26.6 
 
 		 685 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  30.6 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  26.24 
 
 		 688 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  24.91 
 
 		 562 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  27.97 
 
 		 636 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  25.66 
 
 		 677 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  24.19 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  27.75 
 
 		 647 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  27.15 
 
 		 561 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1606  von Willebrand factor, type A  27.8 
 
 		 715 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 562 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  27.05 
 
 		 589 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  26.44 
 
 		 787 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  25.08 
 
 		 550 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  29.77 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  25.22 
 
 		 808 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  25.26 
 
 		 640 aa  44.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  28.27 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  31.96 
 
 		 570 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 543 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>