128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0818 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0818  von Willebrand factor type A  100 
 
 
607 aa  1236    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2441  von Willebrand factor, type A  54.84 
 
 
609 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1513  hypothetical protein  70.21 
 
 
605 aa  854    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00594342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1514  hypothetical protein  53.72 
 
 
594 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283414  hitchhiker  0.00571716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1527  von Willebrand factor type A  56.68 
 
 
601 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0818776  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1863  von Willebrand factor type A  56.24 
 
 
583 aa  592  1e-168  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00271948  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3957  von Willebrand factor type A  49.76 
 
 
618 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.136708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3163  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 
550 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.181499  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  35.24 
 
 
562 aa  293  8e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  34.29 
 
 
546 aa  289  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0945  von Willebrand factor type A  34.26 
 
 
647 aa  287  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.651273 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  33.28 
 
 
547 aa  287  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  34.23 
 
 
543 aa  286  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  34.61 
 
 
561 aa  281  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1116  von Willebrand factor type A  33.9 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7319  von Willebrand factor type A  34.2 
 
 
608 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.505027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2266  von Willebrand factor, type A  30.28 
 
 
596 aa  212  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0327  von Willebrand factor, type A  30.71 
 
 
655 aa  211  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3975  von Willebrand factor type A  30.02 
 
 
583 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.734666  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1261  von Willebrand factor type A  29 
 
 
814 aa  194  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4775  von Willebrand factor type A  27.96 
 
 
615 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165447  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0567  von Willebrand factor type A  28.92 
 
 
587 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2672  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 
599 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.456876  normal  0.172094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3594  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
576 aa  180  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3738  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 
609 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.105397 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0312  von Willebrand factor type A  28.09 
 
 
564 aa  170  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0747  hypothetical protein  28.25 
 
 
587 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.222622  normal  0.398394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7651  hypothetical protein  27.89 
 
 
560 aa  166  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1270  von Willebrand factor type A  31.58 
 
 
593 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.432707  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1377  hypothetical protein  28.97 
 
 
584 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199891  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4679  von Willebrand factor type A  27.46 
 
 
515 aa  154  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5348  von Willebrand factor type A  28.54 
 
 
583 aa  152  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.698925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5347  von Willebrand factor type A  27.24 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.23692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0463  von Willebrand factor type A  29.86 
 
 
547 aa  142  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0568  von Willebrand factor type A  26.02 
 
 
588 aa  135  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  29.42 
 
 
589 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2023  von Willebrand factor type A  25.32 
 
 
586 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000927527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1289  von Willebrand factor type A  32.04 
 
 
594 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 
570 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3360  von Willebrand factor type A  32.76 
 
 
527 aa  98.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.354576  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1580  von Willebrand factor type A  25 
 
 
522 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2800  hypothetical protein  27.49 
 
 
414 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2484  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 
559 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000228446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2918  von Willebrand factor, type A  25.82 
 
 
534 aa  92  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.306616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0012  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.06 
 
 
851 aa  89.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.037328  normal  0.0184635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3368  von Willebrand factor, type A  25.46 
 
 
636 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.893791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3212  von Willebrand factor type A  25.69 
 
 
514 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2578  hypothetical protein  26.11 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11865  hypothetical protein  24.65 
 
 
677 aa  80.1  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.428067  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0766  von Willebrand factor type A  23.89 
 
 
536 aa  78.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0759  von Willebrand factor type A  26.16 
 
 
547 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.09187  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1972  von Willebrand factor type A  32.79 
 
 
847 aa  76.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.865773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2704  von Willebrand factor, type A  30.05 
 
 
851 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2768  hypothetical protein  24.72 
 
 
394 aa  72.8  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0945  von Willebrand factor type A  33.1 
 
 
2166 aa  68.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.775742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4074  hypothetical protein  25.28 
 
 
355 aa  64.7  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0300  von Willebrand factor type A  30.64 
 
 
842 aa  60.8  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3544  von Willebrand factor, type A  34.07 
 
 
966 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1968  von Willebrand factor type A  22.65 
 
 
513 aa  58.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00234323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 
480 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3131  von Willebrand factor, type A  21.02 
 
 
565 aa  57.4  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2845  hypothetical protein  21.57 
 
 
688 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602456  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  28.06 
 
 
490 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49215  predicted protein  25.22 
 
 
582 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.108223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3098  von Willebrand factor, type A  23.63 
 
 
640 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.298521  normal  0.039864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2818  hypothetical protein  20.99 
 
 
685 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2862  hypothetical protein  20.99 
 
 
685 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  27.57 
 
 
643 aa  54.3  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1716  putative chloride channel  25.93 
 
 
951 aa  53.9  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1363  von Willebrand factor type A  32.37 
 
 
972 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0717995  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1735  von Willebrand factor type A  28.23 
 
 
918 aa  52.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  29.65 
 
 
412 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1570  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 
717 aa  52  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.795767  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1287  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 
744 aa  52  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.215804 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 
416 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2192  hypothetical protein  23.46 
 
 
371 aa  51.6  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1252  von Willebrand factor type A  29.51 
 
 
914 aa  51.2  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.25 
 
 
451 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  30.08 
 
 
479 aa  50.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.87 
 
 
903 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1976  von Willebrand factor, type A  28.25 
 
 
766 aa  50.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.81 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1355  hypothetical protein  27.5 
 
 
787 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2675  von Willebrand factor, type A  29.19 
 
 
651 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0397  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 
579 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00126629  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  32.56 
 
 
754 aa  48.9  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1374  hypothetical protein  25.69 
 
 
380 aa  49.3  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1015  von Willebrand (VWA) domain-containing protein  28.65 
 
 
651 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2058  von Willebrand factor, type A  26.7 
 
 
349 aa  48.5  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 
412 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  26.6 
 
 
761 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0236  von Willebrand factor type A  25.97 
 
 
888 aa  48.9  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.64 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2330  hypothetical protein  35.14 
 
 
368 aa  48.5  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.489785  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  29.59 
 
 
828 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  25.41 
 
 
1188 aa  48.1  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22540  hypothetical protein  28.66 
 
 
224 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.149113  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1396  von Willebrand factor, type A  24.38 
 
 
504 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000309187  hitchhiker  0.000141462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  24.02 
 
 
421 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6336  von Willebrand factor type A  29.37 
 
 
808 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>